工资保证金的申报主体需根据合同约定及实际履行情况确定，通常由承担工资支付义务的一方填写，但需结合具体场景分析。以下是详细说明：

1. 合同约定优先原则
   若甲乙双方在劳动合同或专项合同中明确约定了工资保证金的申报义务方（例如约定“乙方负责申报并缴纳工资保证金”），则应优先按照合同约定执行。此时申报主体具有合同效力，双方需按约定履行。

2. 实际履行义务决定主体
   若合同未明确约定，则需根据实际履行情况判断：

   • 甲方为用人单位时：若甲方是工资支付义务的直接承担方（如总承包单位），通常需由甲方申报工资保证金，以确保农民工工资支付到位。
     
   • 乙方为分包单位或实际施工人时：若乙方独立承担某部分工程的工资支付义务（如专业分包），且合同约定乙方需自行保障工人工资，则可能由乙方申报。
     
   • 联合申报场景：部分地区要求总承包单位与分包单位联合申报，此时需双方共同填写并缴纳保证金。

3. 地方性法规的特殊要求
   部分地区对工资保证金的申报主体有强制性规定（如要求总承包单位统一申报），此时需以地方政策为准。例如：

   • 《保障农民工工资支付条例》规定，施工总承包单位应当按照规定存储工资保证金，专项用于支付为所承包工程提供劳动的农民工被拖欠的工资。
     
   • 若乙方为分包单位，但甲方未按规定存储保证金，可能面临行政处罚，此时甲方需补缴并承担责任。

建议行动步骤：

1. 查阅甲乙双方签订的合同，确认是否有关于工资保证金申报的明确约定；
   
2. 核对工程所在地的地方性法规（如住建部门发布的通知），确认是否有强制性申报主体要求；
   
3. 若合同与地方政策冲突，建议优先遵循地方政策，并协商修改合同条款；
   
4. 申报前可向当地劳动保障监察部门或住建部门咨询具体流程，避免因主体错误导致申报无效。

如有进一步疑问（如合同条款解读、地方政策适用等），可直接向我咨询，我会结合具体场景为您详细分析。