结论：擅自从事出版物发行与发行非法出版物同时存在的情况，通常会被定性为两个独立的违法行为，分别依据相关法律法规进行处罚。
详细分析：
擅自从事出版物发行的定性：
- 法律依据：根据《出版管理条例》等相关法律法规，未经批准，擅自设立出版物的出版、印刷或者复制、进口、发行单位，或者擅自从事出版物的出版、印刷或者复制、进口、发行业务，是违法的。
- 定性：这种行为通常被定性为“擅自从事出版物发行活动”，属于无证经营或非法经营出版物的范畴。
- 法律后果：根据违法情节的轻重，可能会面临责令停止违法行为、没收出版物和违法所得、罚款等行政处罚；情节严重的，还可能构成犯罪，依法追究刑事责任。
发行非法出版物的定性：
- 法律依据：同样依据《出版管理条例》等相关法律法规，发行含有禁止内容的出版物，或者发行未经依法审定的出版物的，是违法的。这里的“禁止内容”通常包括反对宪法确定的基本原则、危害国家统一、主权和领土完整、泄露国家秘密、危害国家安全或者损害国家荣誉和利益等。
- 定性：这种行为被定性为“发行非法出版物”，属于传播违法信息的范畴。
- 法律后果：除了可能面临与擅自从事出版物发行活动相似的行政处罚外，如果非法出版物的内容涉及严重违法或犯罪，如煽动颠覆国家政权、传播淫秽物品等，还可能构成相应的犯罪，依法追究刑事责任。
同时存在两种违法行为的定性：
- 定性原则：当擅自从事出版物发行与发行非法出版物同时存在时，这两种行为是独立的，应当分别进行定性。
- 综合处理：在实际处理中，可能会根据违法情节的轻重、违法所得的多少、社会影响的大小等因素，综合考虑对两种违法行为的处罚。例如，可能会对两种违法行为分别进行罚款，然后合并执行；或者对其中一种违法行为进行较重的处罚，对另一种违法行为进行较轻的处罚等。
建议：
- 如果您或他人涉及此类违法行为，建议立即停止相关活动，并主动向相关部门报告情况，配合调查处理。
- 在未来的经营活动中，务必遵守相关法律法规，依法取得出版物发行许可，并确保所发行的出版物内容合法合规。
- 如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律意见。