在解答您的问题“保险合同中的特别约定是否属于格式条款”之前，我们首先需要明确几个核心概念，即什么是格式条款，以及保险合同中通常包含哪些类型的条款。

格式条款，根据定义，是当事人为了重复使用而预先拟定，并在订立合同时未与对方协商的条款。这类条款在保险合同中非常普遍，它们通常表现为保险人（即保险公司）事先拟定的标准化合同条款，投保人只能选择接受或拒绝，而不能对条款内容进行修改或协商。格式条款的使用主要是为了提高交易效率和降低交易成本。

然而，保险合同并非全部由格式条款构成。在保险合同中，除了格式条款外，还存在一种特别约定的条款。这些特别约定条款是在格式条款的基础上，根据投保人的特定需求或保险公司的特殊规定而制定的。它们允许双方在合同中添加或修改某些条款，以满足特定的保险需求或条件。

现在，我们来具体回答您的问题。保险合同中的特别约定不属于格式条款。这是因为特别约定条款是在双方协商的基础上制定的，它们不是为了重复使用而预先拟定的，也不是在订立合同时未与对方协商的。相反，特别约定条款体现了双方对合同内容的特定理解和约定，具有个性化和定制化的特点。

此外，保险合同还可能包含一些非格式化的内容，如投保单、批单等。这些内容通常涉及投保人的具体信息、保险标的的详细描述、保险期间的变更等，它们也不属于格式条款的范畴。

综上所述，保险合同中的特别约定条款不属于格式条款。它们是在格式条款的基础上，根据双方的具体需求和协商结果而制定的，具有个性化和定制化的特点。了解这一点对于投保人来说非常重要，因为它有助于投保人更好地理解合同内容，维护自己的合法权益，并在理赔时避免因误解合同条款而产生纠纷。