结论：公职人员在取保候审期间被扣除的奖金是否需要退还，需结合具体情形判断，主要取决于奖金性质、扣除依据及后续处理结果。以下分情况说明：

1. 若奖金属于“违法所得”或与案件直接关联
   根据《中华人民共和国刑法》第六十四条及《中华人民共和国监察法》相关规定，若奖金被认定为公职人员利用职务便利非法获取的财物（如受贿所得、贪污款项等），或与正在查处的职务违法犯罪行为直接相关（如通过违规操作获得的绩效奖励），则属于“违法所得”，依法应当予以追缴或没收。此时，无论取保候审阶段是否结束，均需退还，且可能面临更严厉的刑事处罚。

2. 若奖金属于合法收入，但因取保候审期间违反规定被扣除
   根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第七十一条，被取保候审的公职人员需遵守“未经批准不得离开所居住的市县”“及时到案”“不得干扰证人作证”等规定。若因违反上述规定（如擅自离境、毁灭证据等）被单位依据内部纪律（如《公务员处分条例》《事业单位工作人员处分暂行规定》）扣除奖金，则扣除行为属于单位对违纪行为的处分，奖金通常无需退还，但扣除的合法性需符合单位规章制度及法定程序。

3. 若奖金扣除缺乏合法依据或程序违法
   若单位扣除奖金的依据不明确（如未在规章制度中明确规定取保候审期间可扣奖金），或未履行法定程序（如未告知扣除理由、未听取本人申辩），则可能构成违法处分。此时，公职人员可通过以下途径维权：

   • 内部申诉：向单位人事部门或纪检监察部门提出书面申诉，要求撤销违法处分决定；
     
   • 行政复议或诉讼：若单位拒绝纠正，可向同级公务员主管部门或上级单位申请复议，或直接向法院提起行政诉讼，主张返还被扣奖金。

建议行动：

• 核实单位扣除奖金的具体依据（如文件名称、条款内容）及程序（如是否出具书面通知、是否听取申辩）；
  
• 若认为扣除行为违法，及时收集证据（如工资条、处分决定书、单位规章制度等），并咨询专业律师评估维权可行性；
  
• 若案件最终被撤销、不起诉或判决无罪，可依据《国家赔偿法》主张赔偿，但需注意奖金扣除是否属于国家赔偿范围需结合具体案情判断。

温馨提示：公职人员涉案期间，单位处分与刑事程序可能并行，建议优先配合调查，同时关注自身合法权益。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作流程。