在劳动关系是与分公司签订的情况下，劳动争议时诉分公司还是总公司，需根据具体情况来确定诉讼主体，以下是详细分析：
分公司具有独立诉讼主体资格的情况
- 法律依据与解释：根据《民事诉讼法》及《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉的解释》，依法设立并领取营业执照的法人分支机构，如分公司，具有民事诉讼主体资格。这意味着，在符合一定条件下，分公司可以独立作为诉讼的被告或原告。
- 适用情形：若分公司具备独立承担民事责任的能力，例如拥有独立的财务账户和资产，且劳动纠纷直接与其经营管理活动相关，那么劳动者可以直接将分公司列为被告提起诉讼。此时，分公司需自行承担判决结果，总公司仅在特定情形下（如分公司财产不足以清偿债务时）承担补充责任。
总公司需承担连带责任的情况
- 法律依据与解释：根据《公司法》的相关规定，分公司不具有法人资格，其民事责任最终由总公司承担。这意味着，在分公司无法独立承担民事责任时，总公司需对剩余债务承担连带责任。
- 适用情形：若案件进入执行阶段，发现分公司无独立财产可供执行，劳动者可以依据《最高人民法院关于民事执行中变更、追加当事人若干问题的规定》，直接申请追加总公司为被执行人。此规定确保了劳动者的权益不会因分公司的财产限制而受损。
特殊情况下总公司的直接责任
- 例外情形：在某些特殊情况下，如总公司通过人事、财务等核心管理权直接控制分公司运营，且存在滥用权利损害劳动者利益的行为时，法院可能突破法人独立地位，直接判令总公司承担全部责任。这通常被称为“揭开公司面纱”或“法人人格否认”原则。
- 判断标准：此类情况需结合具体证据来判断总公司是否存在过度支配行为，以及该行为是否损害了劳动者的合法权益。
综合建议：
- 在面临劳动争议时，劳动者应首先审查与分公司签订的劳动合同内容，以及分公司的实际运营情况和财产状况。
- 若分公司具备独立承担民事责任的能力，且劳动纠纷直接与其相关，劳动者可以直接将分公司列为被告。
- 若分公司无法独立承担民事责任，或劳动者对分公司的财产状况存在疑虑，劳动者可以考虑将总公司列为共同被告或申请执行时追加总公司为被执行人。
- 在整个过程中，劳动者应保留好相关证据，如劳动合同、工资发放记录、社保缴纳证明等，以便在诉讼过程中维护自己的合法权益。
最后，劳动争议的处理往往涉及复杂的法律程序和证据规则，如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。