征地拆迁指挥部设置在路边是否合法，不能一概而论，需结合具体情况判断。以下从不同角度进行分析：
合法性判断依据：
- 设立程序：征地拆迁指挥部的设立需遵循法定程序，包括但不限于政府决策、公告、备案等。若指挥部设立程序合法，且符合相关法律法规的规定，那么其设置地点（包括路边）本身并不直接决定其合法性。
- 地点选择合理性：虽然法律未明确规定征地拆迁指挥部必须设置在特定地点，但地点选择应考虑到工作便利性、安全性、对周边居民的影响等因素。若路边设置指挥部未对交通、安全等造成不良影响，且便于开展工作，那么这种设置方式在合理性上是可接受的。
- 是否妨碍公共利益：若指挥部设置在路边导致交通拥堵、安全隐患增加或对周边居民生活造成不便，且未采取有效措施予以缓解，那么这种设置方式可能因妨碍公共利益而被视为不合法。
可能涉及的法律问题：
- 行政许可：若指挥部设置在路边需要占用公共空间或改变土地用途，可能需获得相关行政部门的许可。未经许可擅自设置，可能构成违法。
- 城市规划与建设法规：指挥部的设置应符合城市规划与建设的相关法规，包括建筑安全、消防安全、环保等方面的要求。若违反这些法规，即使设置在路边，也可能被视为不合法。
- 相邻权保护：若指挥部的设置对周边居民的相邻权（如采光、通风、通行等）造成侵害，且未得到合理补偿或解决，那么这种设置方式可能因侵犯相邻权而被视为不合法。
建议与措施：
- 核查设立程序：若对指挥部设置在路边的合法性有疑问，可首先核查其设立程序是否合法，包括是否获得相关行政部门的批准、是否进行了公告等。
- 评估地点选择合理性：结合实际情况评估指挥部设置在路边的合理性，包括是否对交通、安全等造成不良影响、是否便于开展工作等。
- 咨询相关部门或律师：若仍无法确定其合法性，可咨询当地规划、建设、城管等相关部门或专业律师，以获取更准确的法律意见。
总结来说，征地拆迁指挥部设置在路边是否合法，需综合考虑设立程序、地点选择合理性以及是否妨碍公共利益等因素。若存在疑问或争议，建议及时咨询相关部门或专业律师以获取法律帮助。