结论：在他人非法占有您的厂房及厂房内货物的情况下，您有权请求公安机关进行调查，但需满足一定条件并遵循相应程序。以下从多个角度为您详细分析：
一、法律背景与依据
《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定：
- 根据《刑事诉讼法》的相关规定，公安机关负责刑事案件的侦查工作。当存在犯罪行为，如非法侵入住宅、盗窃、抢劫等，且这些行为可能构成犯罪时，公安机关有义务进行调查。
- 在您的情况下，如果他人非法占有您的厂房及货物，且这种行为涉嫌犯罪（如盗窃罪、侵占罪等），您有权向公安机关报案，请求其进行调查。
《中华人民共和国治安管理处罚法》的相关规定：
- 如果他人的行为尚未构成犯罪，但违反了治安管理规定，如非法侵入他人住宅、扰乱单位秩序等，公安机关也可以根据《治安管理处罚法》进行调查和处理。
二、具体操作与建议
收集证据：
- 在请求公安机关调查之前，您应尽可能收集相关证据，如监控录像、照片、证人证言等，以证明他人非法占有您的厂房及货物的事实。
- 这些证据将有助于公安机关更准确地判断案件性质，并采取相应的调查措施。
向公安机关报案：
- 您应携带相关证据前往当地公安机关报案，详细陈述案件事实，并提交书面报案材料。
- 公安机关在接到报案后，将进行初步审查，并根据案件性质决定是否立案侦查。
配合公安机关调查：
- 在公安机关调查过程中，您应积极配合，提供必要的协助和信息。
- 如果公安机关需要您提供进一步的证据或信息，您应及时响应，以确保调查工作的顺利进行。
三、可能遇到的法律后果与应对
如果公安机关立案侦查：
- 如果公安机关认为您的报案构成犯罪，将立案侦查，并可能采取强制措施（如拘留、逮捕等）对嫌疑人进行控制。
- 在侦查过程中，您应继续配合公安机关的工作，并提供必要的协助。
如果公安机关不予立案：
- 如果公安机关认为您的报案不构成犯罪或证据不足，可能不予立案。
- 在这种情况下，您可以考虑向上一级公安机关申请复议，或者向人民检察院提出立案监督申请。
- 同时，您也可以考虑通过民事诉讼途径来维护自己的权益，如提起侵权之诉或返还原物之诉等。
四、特别提醒
- 在处理此类纠纷时，建议您保持冷静和理性，避免采取过激行为或言语冲突，以免加剧矛盾或引发不必要的法律风险。
- 如果您对法律程序或相关法律规定不熟悉，可以寻求专业律师的帮助，以确保您的权益得到充分保障。
最后，如果您在处理此类纠纷过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我将根据您的具体情况，为您提供专业、全面的法律建议和支持。