村书记办理残疾证本身不会直接影响其工资收入，但可能因残疾等级变化或政策调整间接影响待遇，需分情况讨论：

1. 村书记的工资构成与残疾证无直接关联

村书记的工资通常由基本工资、绩效工资、补贴等构成，其发放标准主要依据《村民委员会组织法》及地方政策，与是否持有残疾证无必然联系。残疾证是认定残疾人身份、享受社会福利的凭证，但村干部的薪酬体系一般不将其作为计算依据。

2. 可能影响工资的间接情形

• 残疾等级变化导致岗位调整：
  若村书记因残疾导致无法履行原职责（如行动不便影响外勤工作），可能被调整至其他岗位（如文书、后勤），而新岗位的工资标准可能低于原岗位。但此类调整需经村民会议或村民代表会议讨论决定，并符合《村民委员会组织法》的程序要求。

• 地方性补贴政策：
  部分地区对残疾人村干部有额外补贴（如交通补贴、护理补贴等），但这类补贴通常独立于基本工资，且需满足特定条件（如残疾等级、家庭经济状况等）。若村书记符合条件，办理残疾证后可能增加收入；反之则无影响。

• 养老保险或医疗保险优惠：
  残疾人可能享受社保缴费减免政策（如个人部分由财政补贴），但这属于社保待遇范畴，与工资收入无直接关系。

3. 需注意的合规性问题

• 禁止以残疾证谋取不当利益：
  若村书记通过虚假材料办理残疾证，或利用职务便利违规申领补贴，可能涉嫌诈骗或滥用职权，需承担法律责任。

• 工资调整需依法依规：
  任何因残疾导致的岗位或工资变动，均需通过民主程序（如村民会议表决）并公示，否则可能引发纠纷。

建议

若村书记因残疾面临实际困难，可主动向乡镇政府或残联咨询当地对残疾人村干部的扶持政策，确保合法权益。如有具体争议（如工资被无故扣减），可进一步向我说明情况，我将结合证据分析维权路径。