结论前置：刑事案件的管辖并非单纯由《公安机关办理刑事案件程序规定》的某一条款来决定哪些不属于公安机关管辖，而是根据《中华人民共和国刑事诉讼法》及相关司法解释的规定，特定类型的刑事案件不由公安机关管辖，而是由人民法院、人民检察院、军队保卫部门、监狱、海警部门等其他机关负责。以下是对这些情形的详细归纳：

一、人民法院直接受理的刑事案件（自诉案件）

1. 告诉才处理的案件：

   • 侮辱、诽谤案：公然侮辱他人或捏造事实诽谤他人，情节严重的行为（但严重危害社会秩序和国家利益的除外）。
   • 暴力干涉婚姻自由案：以暴力手段干涉他人婚姻自由（但致使被害人死亡的除外）。
   • 虐待案：虐待家庭成员，情节恶劣的行为（但致使被害人重伤、死亡的除外）。
   • 侵占案：将代为保管的他人财物非法占为己有，数额较大且拒不退还的行为。

2. 被害人有证据证明的轻微刑事案件：

   • 包括故意伤害（轻伤）、非法侵入住宅、侵犯通信自由、重婚、遗弃等案件。
   • 生产、销售伪劣商品案及侵犯知识产权案（但未严重危害社会秩序和国家利益的）。
   • 属于刑法分则第四章、第五章规定，可能判处三年有期徒刑以下刑罚的案件。

3. 被害人有证据证明应当追究刑事责任，而公安机关或人民检察院不予追究的案件：

   • 如被害人提出控告后，公安机关或人民检察院决定不予立案，但被害人有充分证据的案件。

举例：张某因邻居长期辱骂其家人，情节恶劣，向法院提起自诉，要求追究邻居的刑事责任。此类案件即属于告诉才处理的侮辱案，由人民法院直接受理，不属于公安机关管辖。

二、人民检察院直接受理侦查的刑事案件

人民检察院主要受理职务犯罪案件，包括：

1. 贪污贿赂犯罪：如贪污案、受贿案、挪用公款案、巨额财产来源不明案等。
2. 渎职犯罪：如滥用职权案等，导致公共财产、国家和人民利益遭受重大损失的行为。

此外，人民检察院还管辖在对诉讼活动实行法律监督中发现的司法工作人员利用职权实施的侵犯公民权利、损害司法公正的犯罪案件。

举例：李某作为国家工作人员，利用职务之便，收受他人财物，为他人谋取利益，构成受贿罪。此类案件即由人民检察院直接受理侦查，不属于公安机关管辖。

三、其他机关管辖的刑事案件

1. 军队保卫部门管辖的军人犯罪案件：

   • 军人违反职责的犯罪和军队内部发生的刑事案件。

2. 监狱管辖的罪犯犯罪案件：

   • 罪犯在监狱内犯罪的刑事案件。

3. 海警部门管辖的海域犯罪案件：

   • 海（岛屿）岸线以外我国管辖海域内发生的刑事案件。对于沿海港岙口、码头等区域的刑事案件，则由公安机关管辖。

举例：王某作为海军士兵，在执行任务期间违反职责，构成犯罪。此类案件即由军队保卫部门管辖，不属于公安机关管辖。

法律建议

1. 明确管辖机关：在遇到刑事案件时，首先应明确该案件的管辖机关，以便及时报案或提起诉讼。
2. 咨询专业律师：对于管辖权存在疑问或争议的案件，建议咨询专业律师，以获取准确的法律意见和帮助。
3. 配合调查：无论案件由哪个机关管辖，都应积极配合调查，提供真实、准确的证据和信息，以便案件得到公正、高效的处理。

在实际操作中，若遇到管辖权争议或不明确的情况，可以直接向我咨询，我会根据具体的法律规定和案件情况，为你提供准确的法律意见和帮助。