职务侵占后达成的抵押房产担保借款协议，其有效性需根据具体情况来判断，不能一概而论。以下是从不同角度进行的分析：

1. 协议本身的合法性：

   • 如果抵押房产担保借款协议是在双方自愿、平等、公平的基础上达成的，且协议内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，那么该协议在形式上是合法的。
   • 然而，若协议中的房产系职务侵占所得，这一事实可能影响协议的实质合法性。因为职务侵占是违法行为，其所得财物属于非法所得，以此作为抵押物可能涉及非法财产的处置问题。

2. 职务侵占对协议效力的影响：

   • 若职务侵占行为未被发现或未被追究：在此情况下，抵押房产担保借款协议可能暂时被视为有效，因为从表面上看，它符合合法协议的形式要件。但一旦职务侵占行为被发现并受到法律追究，该协议可能因涉及非法财产而面临被撤销或宣告无效的风险。
   • 若职务侵占行为已被发现或已被追究：在此情况下，抵押房产作为非法所得，其处置将受到法律的严格限制。根据相关法律规定，非法所得不得用于抵押、担保等民事活动。因此，以此类房产作为抵押物的借款协议很可能被认定为无效。

3. 法律后果与风险防范：

   • 法律后果：如果抵押房产担保借款协议被认定为无效，那么根据法律规定，因该协议取得的财产应当予以返还；不能返还或者没有必要返还的，应当折价补偿。有过错的一方应当赔偿对方因此所受到的损失；双方都有过错的，应当各自承担相应的责任。
   • 风险防范：对于涉及职务侵占的抵押房产担保借款协议，建议双方在签订前进行充分的法律审查和风险评估。特别是抵押人应确保抵押物的合法性，避免使用非法所得进行抵押；而借款人则应谨慎审查抵押物的来源和合法性，以降低法律风险。

建议：

• 如果您是抵押人，且抵押房产涉及职务侵占问题，建议您立即停止相关行为，并主动向相关部门说明情况，以避免更严重的法律后果。
• 如果您是借款人，且对抵押房产的合法性存在疑虑，建议您在签订协议前咨询专业律师，进行充分的法律审查和风险评估。

如有任何进一步的问题或需要更具体的法律建议，请直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供更详细的解答。