不定时工作制下，员工辞职时未休年假的工资补偿计算方式与标准工时制基本一致，但需结合具体地方规定和劳动合同约定综合判断。具体分析如下：

1. 年假天数计算依据
   根据《职工带薪年休假条例》第三条，年假天数由员工累计工作时间决定：
   

• 满1年不满10年：5天/年
  
• 满10年不满20年：10天/年
  
• 满20年：15天/年
  不定时工作制不影响年假天数计算，仅需核实员工社保记录、劳动合同等材料确认累计工龄。

1. 未休年假补偿标准
   若员工离职时存在未休年假，用人单位需按日工资收入的300%支付报酬（含正常工资，即额外支付200%）。
   计算基数：劳动合同约定的工资标准，或实际发放的平均工资（需扣除加班费、非常规性奖金等）。

2. 地方性规定差异
   部分地区对不定时工作制有特殊规定，例如：

• 上海：明确不定时工作制员工不适用综合计算工时制，但年假计算仍按国家标准执行；
  
• 广东：规定企业可通过集体合同约定不定时工作制员工的年假安排，但不得低于法定标准。
  建议：结合劳动合同签订地、社保缴纳地的具体政策进一步核实。

1. 实务操作建议
   

• 员工：离职前应书面要求单位安排年假或支付补偿，保留相关证据（如邮件、聊天记录）；
  
• 企业：需在劳动合同或规章制度中明确不定时工作制下的年假安排方式，避免争议。

若您遇到具体争议（如单位拒付补偿、工龄计算分歧等），可直接提供劳动合同、工资条等材料，我将为您进一步分析。