补充协议未盖章但有签字，其法律效力需根据具体情况综合判断。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：

1. 签字主体的法律地位

   • 法定代表人签字：若补充协议上有法定代表人的签字，由于法定代表人有权代表法人行使职权，其签字行为能够直接代表法人的真实意思表示。因此，即使未加盖公章，该补充协议也通常被视为有效。
   • 获得授权的代理人签字：如果签字人是获得企业书面授权的代理人，并且在授权范围内签订补充协议，那么即使没有盖章，该协议也是有效的。这是因为代理人在授权范围内以被代理人名义实施的民事法律行为对被代理人发生效力。
   • 无代表权或代理权的签字人：如果签字人既非法定代表人也未获得企业授权，但相对人有合理理由相信其有代理权（构成表见代理），则补充协议可能被视为有效。然而，如果不构成表见代理且企业事后不追认，则该协议对企业不发生效力。

2. 合同约定的生效条件

   • 补充协议中可能明确约定了生效条件，如“本协议自双方签字并盖章之日起生效”。在这种情况下，只签字不盖章将不满足生效条件，协议因此不发生法律效力。但如果协议中约定的是“签字或盖章后生效”，则签字和盖章具备其一即可使协议生效。

3. 实际履行情况与交易习惯

   • 根据《民法典》的相关规定，如果当事人一方已经履行主要义务，对方接受时，即使未签字盖章，合同也可以视为成立。因此，在实际履行中，如果双方已按照补充协议的约定开始履行各自义务，且对方未提出异议，那么可以基于实际履行行为认定补充协议有效。
   • 此外，某些特定行业或交易中可能存在只签字不盖章即可生效的交易习惯。在这种情况下，应参照相关的法律法规和行业惯例来判断补充协议的有效性。

4. 补充协议的内容合法性

   • 补充协议的内容应当与原合同相关且不冲突，是对原合同未尽事宜的合法、真实补充约定。只要内容合法、真实反映了双方的意愿，并且符合上述任一条件，补充协议就有可能被认定为有效。

建议与指导：

• 在签订补充协议时，建议明确约定生效条件，并尽量遵循法律规定和商业惯例，在可能的情况下加盖印章以增强其法律效力。
• 如果补充协议未盖章但有签字，且存在争议或不确定的情况，建议仔细审查协议的具体内容、相关法律法规以及双方的交易习惯和背景情况。
• 如有必要，可以直接向我咨询，以获取针对具体情况的法律意见，确保自身权益得到充分保障。

综上所述，补充协议未盖章但有签字是否有效，需根据签字主体的法律地位、合同约定的生效条件、实际履行情况与交易习惯以及补充协议的内容合法性等多个因素进行综合判断。