公司起诉员工退还为其缴纳个人部分社保，一般需要仲裁前置，但存在例外情况。以下从不同角度进行分析：
一般情况下的仲裁前置要求
- 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第五条，发生劳动争议，当事人不愿协商、协商不成或者达成和解协议后不履行的，可以向调解组织申请调解；不愿调解、调解不成或者达成调解协议后不履行的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁；对仲裁裁决不服的，除本法另有规定的外，可以向人民法院提起诉讼。
- 公司起诉员工退还为其缴纳的个人部分社保，属于劳动争议范畴。在大多数情况下，公司需要先向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，对仲裁裁决不服的，才能向人民法院提起诉讼。这是因为仲裁前置程序有助于快速、高效地解决劳动争议，减轻法院的诉讼压力，同时也为当事人提供了一个相对灵活、便捷的争议解决途径。
例外情况
- 追索劳动报酬等特定争议：虽然《劳动争议调解仲裁法》规定了仲裁前置原则，但对于某些特定的劳动争议，如追索劳动报酬、工伤医疗费、经济补偿或者赔偿金，且争议金额不超过当地月最低工资标准十二个月金额的，仲裁裁决为终局裁决，裁决书自作出之日起发生法律效力。然而，这一例外并不直接适用于公司起诉员工退还社保个人部分的情况，因为该争议不属于追索劳动报酬等特定类型。
- 双方达成书面仲裁协议：如果公司与员工在劳动合同中或者另行达成书面仲裁协议，约定因社保缴纳问题产生的争议直接由仲裁机构处理，且该协议符合法律规定，那么公司可以直接依据该协议向仲裁机构申请仲裁，而无需先经过劳动争议仲裁委员会的初步仲裁。但这种情况较为特殊，需要双方有明确的约定。
- 法院认为有必要直接受理：在极少数情况下，如果法院认为直接受理该案件更有利于保护当事人的合法权益或者更符合社会公共利益，可能会突破仲裁前置的原则，直接受理公司的起诉。但这种情况非常罕见，且需要法院进行充分的论证和说明。