若违法转包行为已被甲方知晓，核心处理方式取决于合同约定、法律规定及双方协商结果，具体分情况说明如下：

1. 立即停止违法转包行为，主动与甲方协商补救措施
   根据《民法典》第七百九十一条及《建筑法》第二十八条，违法转包（如将工程全部转包给无资质单位、肢解分包等）可能导致合同无效或被解除。若甲方已发现，第一步应立即终止转包行为，避免损失扩大。同时，主动与甲方沟通，提出补救方案（如由原承包人自行完成剩余工程、更换合法分包单位等），争取甲方谅解并继续履行合同。若甲方同意，需签订书面补充协议明确双方权利义务，避免后续纠纷。

2. 评估合同效力及法律责任，准备应对甲方索赔或行政处罚
   若甲方主张解除合同或索赔，需从以下角度分析：

   • 合同效力：违法转包可能导致合同无效（《民法典》第一百五十三条），但若工程已部分履行且质量合格，可参照合同约定结算工程款（《建设工程司法解释一》第二十四条）。
     
   • 民事责任：甲方可能要求赔偿因转包导致的工期延误、质量瑕疵等损失，需根据实际过错分担责任。
     
   • 行政责任：转包方可能面临住建部门处罚（如罚款、停业整顿、降低资质等级等），需配合调查并整改。
     建议提前整理转包合同、履约证据（如施工记录、付款凭证等），以应对潜在诉讼或行政程序。

3. 若甲方坚持解除合同，需妥善处理工程交接与结算
   若协商无果且甲方依据《民法典》第五百六十三条行使法定解除权，需按以下步骤处理：

   • 工程交接：配合甲方完成已完工程验收、资料移交及现场清理，避免因交接不畅被追究额外责任。
     
   • 结算争议：若对工程款存在分歧，可申请造价鉴定或通过诉讼/仲裁解决。注意保留签证、变更单等证据，证明实际施工量。
     
   • 优先受偿权：若工程未竣工，承包人可依据《民法典》第八百零七条主张建设工程价款优先受偿权，但需在法定期限内行使。

行动建议：立即停止转包行为，委托律师审查合同及转包协议，评估法律风险后制定应对策略。若涉及重大工程或复杂纠纷，可进一步提供具体案情，我将结合《招标投标法》《建设工程质量管理条例》等法规提供专项分析。