结论：仅有备注了借款的收条和转账凭证，若双方真实意思表示并非借贷，而是与工程相关，则不能直接认定为借款关系。是否构成借款关系，需结合双方真实意思表示、款项用途等多方面因素综合判断。

分析说明：

1. 收条与转账凭证的法律意义：

   • 收条：通常作为收到款项的凭证，若备注了“借款”，则在一定程度上表明了收款方对款项性质的认可。然而，这种备注并不具有绝对的证明力，尤其是在双方对款项性质存在争议时。
   • 转账凭证：证明了款项的实际流动，是交易发生的重要证据。但同样，转账凭证本身并不能直接证明款项的性质，即是否为借款。

2. 真实借贷合意的重要性：

   • 借款关系的成立，不仅要求有款项的交付，更要求双方之间存在真实的借贷合意。即，双方必须就借款的金额、期限、利率等关键条款达成一致，并有明确的借款意思表示。
   • 若双方的真实意思表示并非借贷，而是与工程相关（如工程款、预付款等），则即使存在收条和转账凭证，也不能直接认定为借款关系。

3. 工程款项与借款的区分：

   • 工程款项：通常与工程建设、施工、材料供应等直接相关，其支付往往基于工程合同、进度报告等文件。
   • 借款：则是一种独立的民事法律关系，其成立和履行不受其他合同关系的影响。
   • 在实践中，区分工程款项和借款的关键在于双方的真实意思表示和款项的实际用途。若款项实际用于工程建设，且双方并无借贷合意，则应认定为工程款项而非借款。

4. 法律后果与建议：

   • 若被错误认定为借款关系，可能导致一方承担不必要的还款责任，甚至面临法律诉讼和财产损失。
   • 因此，在涉及此类争议时，建议双方首先通过协商解决，明确款项的性质和用途。若协商无果，可寻求法律途径解决，如提起民事诉讼或申请仲裁。
   • 在诉讼或仲裁过程中，双方应提供充分的证据证明自己的主张，包括但不限于合同、转账凭证、收条、聊天记录、证人证言等。

进一步行动建议：

• 若您面临此类争议，建议立即收集所有相关证据，包括收条、转账凭证、工程合同、进度报告、聊天记录等，以证明款项的实际性质和用途。
• 咨询专业律师（即我本人，谢万扬律师，专注于公司事务、经济纠纷领域），获取更具体的法律建议和诉讼策略。
• 在律师的指导下，与对方进行协商或准备诉讼材料，以维护自己的合法权益。