关于工资发放问题：

1. 工资应由劳务派遣公司发放：根据劳务派遣的常规操作及法律规定，您通过劳务派遣公司进入工厂工作，您的劳动关系是与劳务派遣公司建立的，而非直接与工厂建立。因此，您的工资应当由劳务派遣公司负责发放。工厂作为用工单位，其责任主要是提供工作条件和支付劳务派遣公司相应的劳务费用，而不直接涉及您的工资发放。

关于进厂三个月后是否会直接转为正式工的问题：

1. 转正并非自动，需依据具体合同和规定：进厂三个月后是否会直接转为正式工，这并非一个固定的法律结果，而是取决于您与劳务派遣公司签订的劳动合同中的具体约定，以及工厂的相关规定。一般来说，劳务派遣工转为正式工需要满足一定的条件，如工作表现、工厂需求等，并且需要经过一定的程序，如考核、面试等。因此，不能简单地认为进厂三个月后就会自动转为正式工。

   • 如果合同中有明确约定：如果您的劳动合同中明确规定了进厂一定时间后（如三个月）可以转为正式工，并且您满足了合同中约定的其他条件（如工作表现、考核合格等），那么您就有可能转为正式工。但这也需要工厂和劳务派遣公司的同意和配合。

   • 如果合同中没有明确约定：如果您的劳动合同中没有明确规定进厂一定时间后可以转为正式工，那么您就不能直接要求转为正式工。此时，您可以与劳务派遣公司和工厂进行协商，看是否可以达成转为正式工的协议。如果协商不成，您可能需要继续以劳务派遣工的身份在工厂工作，或者考虑寻找其他工作机会。

建议与注意事项：

• 仔细阅读劳动合同：在签订劳动合同时，一定要仔细阅读合同条款，特别是关于工资发放、转正条件等方面的约定。如果有不明确或不合理的地方，要及时与劳务派遣公司或工厂进行沟通并协商修改。

• 保留相关证据：在工作过程中，要保留好与工资发放、工作表现等相关的证据，如工资条、工作记录、考核表等。这些证据在将来可能发生的劳动纠纷中会起到重要的作用。

• 及时咨询与维权：如果您对工资发放、转正等问题有疑问或不满，要及时向劳务派遣公司或工厂进行咨询和反映。如果问题得不到解决，您可以考虑向当地的劳动监察部门投诉或寻求法律援助来维护自己的合法权益。

希望以上解答能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。