核心结论：同工厂签订的委外加工合同中约定开票税率是否有效，需结合具体情形判断，以下分情况说明：

1. 若约定税率符合法定税率范围且不违反税收强制性规定
   根据《增值税暂行条例》及实施细则，加工、修理修配劳务的法定税率通常为13%（一般纳税人）或3%（小规模纳税人征收率）。若合同约定的税率与法定税率一致（如明确约定按13%开具增值税专用发票），且双方均具备合法纳税资质，该约定属于对合同价款中税款部分的明确，有效。
   法律依据：《民法典》第510条，合同生效后当事人可就质量、价款等未约定或约定不明的事项补充约定，只要不违反法律强制性规定即有效。

2. 若约定税率低于法定税率或试图通过约定逃避纳税义务
   若合同约定税率低于法定标准（如约定按6%开具发票），或通过“包税条款”（如约定由受托方承担全部税款，但实际通过低开票减少税负），可能因违反《税收征收管理法》第63条“偷税”规定或《民法典》第154条“恶意串通损害国家利益”而无效。
   风险提示：此类约定可能导致税务机关追缴税款、滞纳金，甚至罚款，且合同中逃避纳税义务的条款不会被法院支持。

3. 若约定税率高于法定税率但双方自愿接受
   实践中，部分企业可能因进项抵扣需求（如受托方为小规模纳税人但需开具专票，自愿按一般纳税人税率开票并承担差额税款），约定高于法定税率的开票方式。此类约定若不损害国家利益、公共利益，且双方意思表示真实，原则上有效，但需注意：

   • 受托方需实际按约定税率申报纳税，否则可能构成虚开发票；
     
   • 合同价款应明确区分不含税价与税款，避免因税率变化产生纠纷。

实务建议：

• 签订合同时，建议明确约定“不含税加工费”及“适用税率”，并注明“税率调整时按国家最新规定执行”，以应对税率政策变化；
  
• 避免约定“包税条款”或明显低于法定税率的开票方式，降低税务合规风险；
  
• 若对税率约定有疑问，可直接向我咨询，我会结合具体合同条款和税收政策为您分析。