结论前置：两人共同控制的企业中，其中一人增资确实有可能改变股权结构，但具体是否改变以及改变的程度，取决于增资的具体方式、公司章程的规定以及股东之间的协议。

详细分析：

1. 增资方式的影响：

   • 同比例增资：如果增资是按照现有股东的持股比例进行的，那么增资后，各股东的持股比例将保持不变，股权结构不会发生改变。例如，原股东A和B各持股50%，若他们同比例增资，增资后A和B的持股比例仍然是各50%。
   • 非同比例增资：如果增资不是按照现有股东的持股比例进行的，那么增资后，各股东的持股比例将会发生变化，股权结构也会相应改变。例如，原股东A持股60%，B持股40%，若A增资而B不增资，或者A增资的比例高于B，那么增资后A的持股比例将会上升，B的持股比例将会下降。

2. 公司章程的规定：

   • 公司章程是公司的“宪法”，它规定了公司的基本制度和股东的权利义务。如果公司章程中对于增资有特别的规定，比如增资需要经过全体股东的一致同意，或者增资后股权比例的调整方式等，那么这些规定将会对增资后股权结构的改变产生直接影响。

3. 股东之间的协议：

   • 股东之间可能会签订各种协议，如股东协议、合作协议等，这些协议中可能会包含关于增资和股权结构调整的条款。如果协议中有明确规定，那么增资后股权结构的改变将需要遵循这些协议的规定。

法律建议：

• 审查公司章程和股东协议：在进行增资前，建议仔细审查公司章程和股东之间的协议，了解其中关于增资和股权结构调整的规定，以避免因违反规定而引发的法律纠纷。
• 协商一致：如果增资会改变股权结构，建议与另一股东进行充分协商，达成一致意见后再进行增资。这有助于维护股东之间的和谐关系，避免不必要的法律冲突。
• 法律程序：增资需要遵循一定的法律程序，如召开股东会、修改公司章程、办理工商变更登记等。建议按照法律程序进行增资，以确保增资的合法性和有效性。

可能后果：

• 如果增资未按照公司章程或股东协议的规定进行，或者未经过必要的法律程序，那么增资可能会被认定为无效，股权结构也不会因此发生改变。
• 如果增资引发了股东之间的纠纷，可能需要通过法律途径解决，如诉讼或仲裁等。这将会耗费大量的时间和精力，并可能对公司的正常运营产生不利影响。

因此，在进行增资前，建议充分考虑各种因素，谨慎决策，并咨询专业律师的意见以确保增资的合法性和有效性。有问题可以直接向我咨询。