结论：公司股东结构中的两个公司，确实可以通过股权变更的方式变更为个人股东，但这一过程需要遵循一定的法律程序和规定。
法律背景与程序：
股权转让协议：首先，原公司股东（即两个公司）需要与拟受让股权的个人签订股权转让协议。这份协议应明确双方的权利和义务，包括但不限于股权转让的价格、支付方式、支付时间、股权变更登记的时间等关键条款。
公司内部决策程序：根据《公司法》的相关规定，股权转让通常需要经过公司股东会或董事会的决议通过。特别是当股权转让涉及公司控制权的变更时，这一程序尤为重要。因此，在股权转让前，应确保公司内部已经完成了相应的决策程序。
工商变更登记：股权转让协议签订并经过公司内部决策程序通过后，接下来需要到工商行政管理部门办理股权变更登记手续。这一步骤是股权转让生效的法定要件，未经登记，不得对抗善意第三人。在办理变更登记时，需要提交一系列文件，包括但不限于股权转让协议、公司股东会或董事会决议、公司章程修正案等。
税务处理：股权转让还可能涉及税务问题。根据税法的相关规定，股权转让所得应缴纳个人所得税或企业所得税（取决于转让方和受让方的性质）。因此，在股权转让过程中，应确保税务处理的合规性，避免因税务问题而引发的法律风险。
可能遇到的法律后果与建议：
法律合规性：在整个股权变更过程中，必须确保所有步骤都符合法律法规的规定。否则，可能会面临行政处罚、民事赔偿甚至刑事责任等法律后果。因此，建议在进行股权变更前，咨询专业律师或法律机构，以确保整个过程的合法性和合规性。
合同条款的严谨性：股权转让协议是股权变更过程中的核心文件。因此，在签订协议时，应确保合同条款的严谨性和完整性，避免因合同条款不清或存在漏洞而引发的纠纷。
公司治理结构的调整：股权变更后，公司的治理结构可能会发生变化。因此，建议公司在股权变更后及时调整公司治理结构，确保公司的正常运营和决策效率。
特殊情况考虑：
如果原公司股东（即两个公司）之间存在关联关系或特殊协议安排，股权变更过程可能会更加复杂。在这种情况下，建议在进行股权变更前，对相关协议进行仔细审查和分析，以确保股权变更不会违反相关协议或法律法规的规定。
如果拟受让股权的个人存在不良信用记录或法律纠纷等问题，也可能会对股权变更过程产生影响。因此，在进行股权变更前，应对拟受让方的信用状况和法律纠纷情况进行调查和了解。
总之，公司股东结构中的两个公司可以通过股权变更的方式变更为个人股东，但这一过程需要遵循一定的法律程序和规定。如果你在这一过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。