通常情况下，公司有两个股东时，不可以由一人股东单独增资。这一结论主要基于公司法的相关规定以及公司增资决策的机制。以下从不同角度进行详细分析：
一、公司法规定与增资决策机制
根据《公司法》的相关规定，公司增资属于公司层面的重要决策，必须由股东会作出相应的决议。这意味着，增资并非由单个股东决定，而是需要经过股东会的集体讨论和表决。股东会作为公司的最高权力机构，其决议应当体现全体股东的意志，确保增资决策的公平性和合理性。
二、单独增资可能带来的问题
股权结构失衡：如果允许单个股东单独增资，那么该股东的股权比例将会增加，而其他股东的股权比例则会被相应稀释。这种股权结构的失衡可能会破坏公司原有的治理结构，影响公司的稳定运营。
损害其他股东权益：单独增资可能导致其他股东在公司中的话语权和决策权减弱，甚至可能损害他们的经济利益。例如，增资后公司可能进行新的投资或业务扩张，而其他股东由于股权比例下降，可能无法充分参与这些决策过程。
三、特殊情况下的单独增资
尽管通常情况下不允许单个股东单独增资，但如果公司章程中有特殊规定，比如约定某一股东在特定的情形下拥有单独增资的权利，并且这个规定没有违反法律法规的强制性规定，那么应当按照约定来执行。这种情况下，单独增资是合法的，但也需要确保其他股东的权益不受损害。
四、法律建议与后续行动
审查公司章程：如果公司考虑进行增资，首先应当审查公司章程中关于增资的规定。如果章程中没有明确规定或规定不明确，建议通过股东会决议来明确增资的方式和程序。
确保公平合理：在增资过程中，应当确保所有股东的权益得到公平对待。可以通过协商、评估等方式来确定增资的价格和比例，避免出现不公平的情况。
咨询专业律师：如果公司在增资过程中遇到法律问题或争议，建议及时咨询专业律师。律师可以根据公司的具体情况和法律法规的要求，提供专业的法律意见和解决方案。
总结来看，公司有两个股东时，通常情况下不可以由一人股东单独增资。这主要是基于公司法的规定和增资决策的机制。然而，在特殊情况下，如果公司章程中有明确规定且不违反法律法规的强制性规定，单独增资也是可能的。但无论如何，都应当确保增资过程的公平性和合理性，保护所有股东的权益。如果您在公司增资方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。