公司公章被盗用签订的协议，在法律上一般被视为无效，但具体还需根据实际情况来判断，且公司需及时采取措施以维护自身权益。以下从不同角度为你详细分析：
一、协议的法律效力
公章的法律意义：
- 公章是公司对外进行法律行为的重要标识，具有代表公司意志的法律效力。然而，当公章被盗用时，其代表的公司意志并非真实意思表示。
协议无效的情形：
- 根据《民法典》的相关规定，行为人与相对人以虚假的意思表示实施的民事法律行为无效。若公司能证明公章是被盗用，且签订协议并非公司真实意思表示，则该协议可被认定为无效。
- 另外，如果相对方明知或应知公章是被盗用，仍与公司签订协议，那么该相对方可能不构成善意相对人，协议也可能因此无效。
协议有效的例外：
- 如果公司未能及时采取措施，如未及时报警、未公告公章作废等，导致相对方有理由相信公章的使用是公司真实意思表示，那么协议可能被认定为有效。这种情况下，公司可能需要承担因公章被盗用而产生的法律责任。
二、公司应采取的措施
立即报警：
- 一旦发现公章被盗用，公司应立即向公安机关报案，以便尽快追回公章并查明事实真相。
公告公章作废：
- 公司应在报纸或其他公开媒体上发布公告，声明公章已作废，以防止不法分子继续使用公章进行非法活动。
收集证据：
- 公司应收集相关证据，如报警记录、公告截图、公章使用记录等，以证明公章是被盗用且签订协议并非公司真实意思表示。
与相对方协商或诉讼：
- 公司可以尝试与相对方协商解决争议，如撤销协议、赔偿损失等。如果协商无果，公司可以向法院提起诉讼，要求确认协议无效并追究相关责任人的法律责任。
三、可能面临的法律后果
如果协议被认定无效：
- 公司无需履行协议中的义务，但可能需要承担因公章被盗用而给相对方造成的合理损失（如相对方因信赖协议而产生的直接损失）。
如果协议被认定有效：
- 公司可能需要履行协议中的义务，并承担因违约而产生的法律责任。同时，公司还可以向盗用公章的责任人追偿因履行协议而产生的损失。
建议：公司在日常经营中应加强对公章的管理和保护，如设置专门的公章保管人员、建立公章使用登记制度等，以防止公章被盗用或滥用。如果遇到公章被盗用的情况，公司应及时采取措施并咨询专业律师（即我，董飞律师，专注于股权转让、刑事辩护领域），以便更好地维护自身权益。