公司由谁主导确实不完全看股权占比，这主要涉及到公司治理结构和实际控制权的分配问题。以下从多个角度进行分析：

1. 股权结构与控制权的关系：

   • 股权结构是公司治理的基础，它决定了股东在公司中的权益比例。然而，股权占比并不直接等同于控制权。在某些情况下，即使股东持股比例不高，也可能通过其他方式获得公司的实际控制权。
   • 例如，通过签署一致行动人协议，多个小股东可以联合起来，共同行使表决权，从而在公司决策中占据主导地位。此外，一些股东可能通过持有特殊类型的股份（如优先股）或享有特定的表决权安排（如双层股权结构），来增强其对公司的影响力。

2. 公司章程与治理结构：

   • 公司章程是公司的“宪法”，它规定了公司的基本制度和治理结构。在公司章程中，可以明确规定公司的决策机制、董事会的组成和职权、股东会的议事规则等。
   • 通过合理设计公司章程，可以调整股权与控制权的关系。例如，可以规定某些重大事项需要特定比例的股东同意才能通过，或者赋予董事会更大的决策权，从而在一定程度上削弱股权占比对控制权的影响。

3. 实际控制人的认定：

   • 在公司法实践中，实际控制人是指虽不是公司的股东，但通过投资关系、协议或者其他安排，能够实际支配公司行为的人。
   • 实际控制人的认定不仅考虑股权占比，还综合考虑其他多种因素，如是否担任公司董事、高级管理人员，是否对公司决策产生重大影响等。因此，即使某个股东持股比例不高，但如果他能够实际支配公司的行为，也可能被认定为实际控制人。

4. 案例与实务操作：

   • 在实务中，存在许多股权占比不高但实际控制公司的案例。例如，一些创业公司的创始人可能通过持有少量股权，但凭借其技术、市场或管理等方面的优势，获得投资人的信任和支持，从而在公司中占据主导地位。
   • 此外，一些大型企业集团可能通过复杂的股权结构和治理安排，实现母公司对子公司的实际控制，而母公司并不一定持有子公司的多数股权。

法律建议：

• 对于股东而言，要关注公司章程的制定和修改，确保自己的权益得到充分保障。同时，要积极参与公司治理，通过行使表决权、提名董事等方式，维护自己的利益。
• 对于公司而言，要合理设计股权结构和治理结构，明确各股东的权益和责任，避免出现股权纠纷和控制权争夺等问题。同时，要加强内部管理，确保公司决策的合法性和合规性。

如果您在公司治理或股权结构方面遇到任何问题或困惑，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。