结论：员工在工厂干了10年被公司直接把档案删了，这是不合法的行为，员工可以通过多种途径来维护自己的合法权益。
一、法律背景与依据
根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关法律法规，用人单位有义务妥善保管员工的档案资料，包括劳动合同、工资单、考勤记录等，这些档案是员工工作经历和权益的重要证明。公司直接删除员工档案，可能构成对员工合法权益的侵害，员工有权要求公司恢复档案或承担相应的赔偿责任。
二、具体法律建议
与公司沟通：
- 员工首先应当尝试与公司进行沟通，明确要求公司恢复被删除的档案或提供相应的证明材料。
- 在沟通过程中，员工可以保留好相关的沟通记录，如邮件、短信、录音等，以备后续维权之需。
向劳动监察部门投诉：
- 如果与公司沟通无果，员工可以向当地的劳动监察部门投诉，要求其介入调查并责令公司恢复档案或承担赔偿责任。
- 劳动监察部门有权对用人单位的违法行为进行查处，并保护劳动者的合法权益。
申请劳动仲裁：
- 员工还可以向当地劳动仲裁委员会提起劳动仲裁，要求公司恢复档案或赔偿因档案丢失而造成的损失。
- 劳动仲裁委员会将依法进行裁决，并要求用人单位承担相应的法律责任。
提起诉讼：
- 如果劳动仲裁未能解决问题，员工还可以依法向人民法院提起诉讼，进一步维护自己的合法权益。
- 在诉讼过程中，员工需要提供充分的证据证明公司存在删除档案的行为，并证明因此给自己造成了损失。
三、可能面临的法律后果
- 如果公司确实存在删除员工档案的行为，且无法提供合理的解释和证明，那么公司可能面临劳动监察部门的处罚，包括罚款、责令改正等。
- 同时，公司还可能需要承担因档案丢失而给员工造成的损失赔偿责任，包括但不限于工资损失、社保损失、晋升机会损失等。
四、注意事项
- 员工在维权过程中，应当保持冷静和理性，避免采取过激行为或言语攻击公司。
- 员工应当妥善保管好与工作相关的所有证据和材料，包括劳动合同、工资单、考勤记录、沟通记录等，以备后续维权之需。
- 如果员工对法律程序不熟悉或担心自己无法有效维权，可以寻求专业律师的帮助和指导。
作为储英芳律师，我专注于医疗事故赔偿、工伤赔偿领域，如果你在劳动工伤方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。