关于“土地流转合同补偿协议写钱是否违法”的问题，结论前置：土地流转合同补偿协议中明确写明补偿金额，本身并不违法，但需确保协议内容合法合规，且符合相关法律法规的规定。 以下是对该问题的详细分析：

1. 协议合法性的基本原则：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，民事法律行为有效的条件包括：行为人具有相应的民事行为能力、意思表示真实、不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。土地流转合同补偿协议作为民事法律行为的一种，同样需要满足这些条件。
   • 协议中明确写明补偿金额，是双方真实意思表示的体现，只要该金额不违反法律法规的强制性规定，且双方对此无异议，那么这一条款就是合法的。

2. 土地流转合同补偿协议的特殊要求：

   • 土地流转合同补偿协议通常涉及农村土地承包经营权的流转，因此需要遵守《中华人民共和国农村土地承包法》等相关法律法规的规定。
   • 根据这些法律法规，土地流转应当遵循平等、自愿、有偿的原则，任何组织和个人不得强迫或者阻碍承包方进行土地承包经营权流转。同时，土地流转的补偿标准也应当合理，不得损害农民的合法权益。

3. 可能存在的违法情形：

   • 如果土地流转合同补偿协议中的补偿金额明显低于市场价值，且存在欺诈、胁迫等情形，导致农民的合法权益受到损害，那么该协议可能因违反法律法规的强制性规定而被认定为无效。
   • 另外，如果协议中涉及的土地流转行为本身违反了法律法规的规定，如未经批准擅自改变土地用途等，那么该协议也可能因违法而无效。

4. 法律建议：

   • 在签订土地流转合同补偿协议时，双方应当充分了解相关法律法规的规定，确保协议内容合法合规。
   • 补偿金额的确定应当参考市场价值，并考虑土地的实际状况、流转期限等因素，确保补偿的合理性和公平性。
   • 如果对协议内容存在疑问或争议，建议咨询专业律师或相关部门的意见，以避免潜在的法律风险。

举例说明：假设甲村村民张三将其承包的土地流转给乙公司，双方签订了土地流转合同补偿协议，并明确写明了补偿金额。如果该协议是在平等、自愿、有偿的基础上签订的，且补偿金额合理，没有违反法律法规的强制性规定，那么该协议就是合法的。反之，如果补偿金额明显低于市场价值，且存在欺诈、胁迫等情形，那么该协议可能因违法而无效。

总结与进一步思考：土地流转合同补偿协议中明确写明补偿金额本身并不违法，但需确保协议内容合法合规，并符合相关法律法规的规定。在签订协议时，双方应当充分了解相关法律法规，确保协议的合法性和有效性。如果有任何疑问或争议，建议直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见。