结论：公司变卖时，占比55%的大股东不签字，其效力需根据具体情况来判断，不能一概而论说有效或无效。以下从不同角度进行分析：
公司章程与股东会决议：
- 公司章程规定：首先，需要查阅公司章程中关于公司变卖或重大资产处置的决策程序。如果公司章程明确规定了此类决策需要特定比例的股东同意（例如三分之二以上或全体股东一致同意），那么即使占比55%的大股东不签字，只要未达到章程规定的比例，该变卖行为在程序上可能被视为无效。
- 股东会决议：如果公司章程未明确规定，或者规定与当前情况不完全吻合，那么应依据《公司法》的相关规定。根据《公司法》，股东会会议作出修改公司章程、增加或者减少注册资本的决议，以及公司合并、分立、解散或者变更公司形式的决议，必须经代表三分之二以上表决权的股东通过。但公司变卖并不直接等同于上述列举的情形，除非变卖行为实质上导致了公司合并、分立、解散或变更形式等后果。若公司变卖不涉及这些重大变化，且公司章程无特别规定，则可能只需简单多数（即过半数）表决权通过即可。在此情况下，55%的股权比例已超过半数，理论上可以形成有效决议，但实际操作中还需考虑其他股东的意见和可能的法律挑战。
大股东的权利与义务：
- 权利行使：大股东作为公司的重要投资者，享有与其股权比例相应的表决权。然而，权利的行使并非无限制的，必须遵守公司章程和法律法规的规定。如果大股东拒绝签字是基于合理的商业判断或法律担忧，且其拒绝签字的行为符合公司章程和法律法规的规定，那么其不签字的行为可能是合法的。
- 义务履行：同时，大股东也负有对公司和其他股东的忠实义务和勤勉义务。如果大股东无正当理由拒绝签字，且该行为损害了公司或其他股东的利益，那么大股东可能需要承担相应的法律责任。
实际操作中的考量：
- 协商与沟通：在公司变卖过程中，大股东不签字可能会引发一系列法律问题和商业纠纷。因此，建议公司管理层和其他股东与大股东进行充分的协商和沟通，了解其拒绝签字的原因和顾虑，并尝试寻求共识和解决方案。
- 法律途径：如果协商无果，且大股东的不签字行为确实阻碍了公司变卖的进程或损害了公司或其他股东的利益，那么公司或其他股东可以考虑通过法律途径来解决争议。例如，可以提起股东会决议无效或撤销之诉，或者要求大股东承担违约责任等。
建议：
- 在处理此类问题时，建议公司首先查阅并遵循公司章程的相关规定。
- 如果公司章程无明确规定或规定不明确，建议咨询专业律师以了解相关法律法规和司法实践中的通说和少数说。
- 在实际操作中，应注重协商与沟通，尽量通过和平方式解决争议。
- 如果协商无果且争议无法避免，应及时采取法律措施以维护公司和其他股东的合法权益。
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