串通投标案件中，检察院退赃后是否不予起诉，需结合具体案情综合判断，无法一概而论，但特定情形下存在不予起诉的可能性。以下从不同角度详细分析：

一、法律依据与不起诉条件

根据《中华人民共和国刑事诉讼法》及相关司法解释，检察院作出不起诉决定通常基于以下情形：

1. 犯罪情节显著轻微：若串通投标行为涉及的项目金额较小，对市场秩序和其他投标人权益损害轻微，且未造成实质性不良影响，可能符合不起诉条件。
2. 证据不足：若关键证据缺失或存疑，如证人证言矛盾、缺乏书面文件等，导致无法确切证明串通投标行为，检察院可能遵循“疑罪从无”原则作出不起诉决定。
3. 嫌疑人表现：嫌疑人若主动退赃、赔偿损失，且有自首、立功等情节，或积极认罪认罚，真诚悔罪并愿意接受处罚，可能增加不予起诉的可能性。

二、退赃对不予起诉的影响

退赃是嫌疑人表现中的一个重要方面，它体现了嫌疑人对犯罪行为的悔过态度和对受害方损失的弥补意愿。在串通投标案件中，主动退赃可能成为检察院考虑不予起诉的一个积极因素，但并非决定性因素。检察院会综合评估犯罪情节、证据情况以及嫌疑人的整体表现来作出决定。

三、具体情形分析

1. 犯罪情节轻微且退赃积极：

   • 若串通投标行为情节轻微，且嫌疑人在案发后迅速退赃，积极赔偿受害方损失，同时表现出真诚的悔过态度，检察院可能考虑不予起诉。

2. 证据不足且退赃：

   • 若案件证据不足，无法清晰证明串通投标行为，且嫌疑人在此时选择退赃，可能进一步削弱检察院起诉的决心，从而增加不予起诉的可能性。

3. 存在其他从轻或减轻情节：

   • 除了退赃外，若嫌疑人还存在自首、立功、认罪认罚等其他从轻或减轻情节，检察院在综合评估后可能作出不予起诉的决定。

四、实际案例参考

在实际案例中，因证据不足或犯罪情节轻微而获得《不起诉决定书》的情况并不罕见。例如，某些串通投标案因关键证据缺失或存疑，最终导致检察院作出不起诉决定。同时，也有涉事企业在案发后积极整改，退赃退赔，并提交合规承诺，最终获得检察机关的不起诉决定。

五、建议与总结

1. 及时寻求专业帮助：

   • 面对串通投标指控时，嫌疑人应及时寻求专业律师的帮助，以便更好地了解自己的法律处境，制定有效的应对策略。

2. 积极配合调查与退赃：

   • 嫌疑人应积极配合调查，如实供述罪行，并主动退赃退赔，以展示真诚的悔过态度和对受害方损失的弥补意愿。

3. 加强内部管理：

   • 企业应加强内部管理，建立健全相关制度机制，防范类似风险的发生，避免陷入法律纠纷。

综上所述，串通投标案件中检察院退赃后是否不予起诉需结合具体案情综合判断。若您或您的企业面临此类问题，可直接向我咨询，我将根据具体情况提供详细的法律分析和建议。