未办理结算的工程，并非必须按合同施工期限申报收入，需分情况讨论：
从合同约定与收入确认原则来看：
- 一般情况下，工程收入的确认应遵循权责发生制原则，即收入应在提供劳务或完成工程进度，且相关经济利益很可能流入企业时确认，而非单纯依据合同施工期限。如果工程虽未到合同施工期限，但已实际完成了一定工作量，且满足收入确认条件（如工程进度可可靠计量、经济利益流入可能性大等），企业应按实际完成进度确认收入，而非等到合同施工期限届满。
- 反之，若工程已到合同施工期限，但因各种原因（如质量问题、业主变更要求等）尚未完成结算，且不满足收入确认条件（如工程进度无法可靠计量、经济利益流入存在不确定性等），企业也不应仅因合同施工期限已到而确认收入。此时，企业应根据实际情况，按照完工百分比法或其他合理方法，谨慎估计工程进度和收入金额，并在财务报表附注中充分披露相关信息。
从税务处理角度来看：
- 税务上，工程收入的确认可能受到税法规定的影响。例如，增值税方面，纳税人提供建筑服务取得预收款时，应在收到预收款时，以取得的预收款扣除支付的分包款后的余额，按照规定的预征率预缴增值税。但这并不意味着此时就确认了全部工程收入，而是预缴税款的一种方式。
- 企业所得税方面，企业应按照权责发生制原则确认收入，但税法可能对某些特定情况下的收入确认时间有特殊规定。例如，对于跨年度完成的工程，企业可能需要在年度终了时，根据工程进度和合同约定，合理估计并确认当年应计入应纳税所得额的收入金额。
从实际操作与风险防范角度来看：
- 在实际操作中，企业应建立健全的工程收入确认制度，明确收入确认的条件、方法和流程，确保收入确认的准确性和合规性。同时，企业应加强与业主的沟通协调，及时办理工程结算手续，明确双方的权利和义务，减少因结算问题引发的收入确认风险。
- 如果工程因业主原因或其他不可抗力因素导致长期无法办理结算，企业应考虑采取法律手段维护自身权益，如提起诉讼或申请仲裁等。在诉讼或仲裁过程中，企业应提供充分的证据证明工程进度和收入金额，以便法院或仲裁机构作出公正裁决。