结论：公司合同中写明陪产假扣工资，这一条款是不合法的。

法律背景与解释

1. 陪产假的法律性质： 陪产假，也称为护理假，是男性员工在妻子生育期间享有的带薪休假权利。这一权利是基于国家对家庭、母婴健康的关怀以及性别平等的原则而设立的。陪产假期间，员工应享受与正常工作期间相同的工资待遇，这是法律对员工权益的保障。

2. 工资支付的相关规定： 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，员工在法定休假日、婚丧假期间以及依法参加社会活动期间，用人单位应当依法支付工资。陪产假作为法定休假的一种，员工在陪产假期间理应获得全额工资。

3. 合同条款的合法性审查： 公司合同中的条款必须符合国家法律法规的规定。如果合同中的条款与法律法规相抵触，那么该条款是无效的。因此，公司合同中写明陪产假扣工资，这一条款违反了国家关于工资支付和陪产假的规定，是不合法的。

法律建议与行动指南

1. 与公司协商： 如果你发现公司合同中存在这样的不合法条款，首先可以尝试与公司进行协商，要求公司修改合同条款，确保你在陪产假期间能够获得全额工资。

2. 向劳动监察部门投诉： 如果公司拒绝修改合同条款或者在实际操作中仍然扣减你的工资，你可以向当地的劳动监察部门投诉。劳动监察部门有权对公司的违法行为进行调查和处理，并保障你的合法权益。

3. 申请劳动仲裁或提起诉讼： 如果劳动监察部门的处理结果不能满足你的需求，你还可以向劳动仲裁机构申请劳动仲裁，或者向人民法院提起诉讼。通过法律途径来维护自己的合法权益，确保在陪产假期间获得应有的工资待遇。

可能的法律后果

如果公司坚持执行不合法条款，扣减员工在陪产假期间的工资，那么公司可能面临以下法律后果：

• 行政处罚：劳动监察部门可以对公司进行行政处罚，包括罚款、责令改正等。
• 民事赔偿：员工有权要求公司补发被扣减的工资，并可能要求公司支付额外的经济补偿。
• 声誉损害：公司的违法行为还可能对其声誉造成损害，影响公司的业务发展和员工招聘。

综上所述，公司合同中写明陪产假扣工资是不合法的。如果你遇到这样的情况，建议与公司协商、向劳动监察部门投诉或者通过法律途径来维护自己的合法权益。如果你还有其他关于劳动工伤或合同纠纷的问题，可以直接向我咨询。