结论：男方赠与女方房子，且房子已登记在女方名下，同时存在手写赠予协议的情况下，该赠予协议一般具有法律效力，但具体效力可能受到多种因素的影响。以下从不同角度进行详细分析：
一、赠予协议的法律效力
形式要件：
- 手写赠予协议，只要内容明确、双方意思表示真实，且不存在违反法律、行政法规的强制性规定或公序良俗的情形，即具备法律效力。
- 赠予协议无需特定形式，口头或书面均可，但书面形式更有利于证明双方的真实意思表示和赠予事实的存在。
实质要件：
- 赠予协议必须包含赠予人和受赠人的基本信息、赠予财产的具体描述（如房产的地址、面积、产权证号等）、赠予的条件和方式等关键要素。
- 双方必须具有完全民事行为能力，且赠予行为出于自愿，不存在欺诈、胁迫等情形。
二、房产登记的影响
物权变动：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记，发生效力。因此，房子已登记在女方名下，意味着女方已成为该房产的合法所有人。
- 房产登记是物权变动的公示方式，具有对抗第三人的效力。即使赠予协议存在争议，已登记的房产所有权通常受到法律保护。
赠予协议与房产登记的关系：
- 赠予协议是双方之间的内部约定，而房产登记是物权变动的外部公示。在两者一致的情况下，赠予协议的法律效力得到进一步确认。
- 如果赠予协议与房产登记存在冲突（如协议约定赠予但未办理登记），则可能需要根据具体情况判断赠予的效力及房产的归属。
三、可能影响赠予协议效力的因素
赠予目的的合法性：
- 如果赠予行为涉及违法或违背公序良俗的目的（如为了逃避债务、进行非法交易等），则赠予协议可能被认定为无效。
赠予人的处分权：
- 赠予人必须对赠予的房产拥有合法的处分权。如果房产存在共有情况（如夫妻共同财产），则赠予行为需要得到其他共有人的同意或追认，否则可能构成无权处分，影响赠予协议的效力。
赠予协议的履行情况：
- 如果赠予协议中约定了特定的履行条件或方式（如分期赠予、附条件赠予等），则赠予行为的效力可能受到这些条件或方式的限制。如果赠予人未按照约定履行赠予义务，受赠人可能无法直接取得房产的所有权。
四、法律建议
确保赠予协议的合法性和有效性：
- 双方应确保赠予协议的内容明确、合法，且双方意思表示真实。如有必要，可以请专业律师起草或审核赠予协议。
及时办理房产登记手续：
- 赠予行为完成后，双方应及时办理房产登记手续，以确保受赠人成为房产的合法所有人。这有助于避免后续可能出现的产权纠纷。
保留相关证据：
- 双方应保留与赠予行为相关的所有证据（如赠予协议、房产登记证明、付款凭证等），以备不时之需。这些证据在后续可能出现的法律纠纷中具有重要的证明作用。
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