结论：公职人员证书挂靠费用退赔后是否还算兼职取酬，需根据具体情况判断，若挂靠行为本身构成兼职取酬且未改变其违规性质，即便退赔费用，仍可能被认定为兼职取酬行为；若退赔行为彻底纠正了违规行为，且后续无类似行为，则可能不再被认定为兼职取酬。以下从不同角度详细分析：
一、公职人员兼职取酬的法律规定
根据《中华人民共和国公务员法》及相关规定，公职人员不得违反规定从事或者参与营利性活动，在企业或者其他营利性组织中兼任职务。证书挂靠，本质上是一种将个人资质出租给企业以获取报酬的行为，若公职人员参与其中，很可能被视为兼职取酬，违反了公职人员的职业操守和纪律要求。
二、退赔费用对兼职取酬认定的影响
退赔行为本身不改变违规性质：
- 即便公职人员退赔了证书挂靠的费用，这并不意味着其之前的挂靠行为就变得合法或合规。退赔行为更多是一种对违规行为的纠正或补救措施，而非对违规性质的改变。
- 因此，如果挂靠行为本身构成兼职取酬，那么即便退赔了费用，该行为仍可能被认定为兼职取酬。
退赔后的行为表现：
- 如果公职人员在退赔费用后，彻底停止了证书挂靠等违规行为，且没有其他兼职取酬的行为，那么其后续的行为可能不再被视为兼职取酬。
- 然而，如果公职人员在退赔后仍继续从事类似的违规行为，或者存在其他兼职取酬的情况，那么其退赔行为可能无法改变其整体上的违规性质。
三、实际案例与司法实践
- 在实际案例中，对于公职人员证书挂靠费用的退赔与兼职取酬的认定，往往需要结合具体证据和情况来判断。例如，如果公职人员能够证明其挂靠行为并未获取实际报酬，或者退赔行为是在被查处前主动进行的，且后续无类似行为，那么其可能不会被认定为兼职取酬。
- 但另一方面，如果公职人员挂靠行为明显，且退赔行为是在被查处后进行的，或者退赔后仍继续从事违规行为，那么其很可能被认定为兼职取酬，并受到相应的纪律处分或法律制裁。
四、建议与风险提示
遵守法律法规：
- 公职人员应严格遵守相关法律法规和纪律要求，不得从事或参与任何形式的营利性活动或兼职取酬行为。
及时纠正违规行为：
- 如果公职人员已经参与了证书挂靠等违规行为，应立即停止并退赔相关费用，以减轻或避免可能的法律后果。
咨询专业律师：
- 在面对复杂的法律问题时，公职人员应及时咨询专业律师，以获取准确的法律意见和帮助。虽然这里我作为尉忠律师已经给出了一些分析，但具体案件仍需具体分析，以确保权益得到最大程度的保护。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。