针对药店打折吃回扣被公司发现的情况，解决方式需根据具体情节和公司规定来综合判断，但通常涉及以下几个关键方面：

1. 法律责任分析：

   • 商业贿赂的法律定性：根据《中华人民共和国反不正当竞争法》及相关规定，药店员工在打折销售过程中吃回扣，若涉及向交易对方或其工作人员提供财物或其他利益以谋取交易机会或竞争优势，可能构成商业贿赂行为。这不仅违反了商业道德，还可能面临行政处罚，如罚款、没收违法所得等，情节严重的还可能构成犯罪，如非国家工作人员受贿罪或对非国家工作人员行贿罪。
   • 公司内部规定：除了法律责任外，药店员工还需遵守公司的内部规章制度。若公司明确禁止员工在销售过程中吃回扣或接受不正当利益，员工的行为将违反公司规定，可能面临内部纪律处分，如警告、罚款、解雇等。

2. 解决策略建议：

   • 主动承认错误并配合调查：一旦被公司发现，员工应主动承认错误，并积极配合公司的调查工作。这有助于减轻公司的损失，也可能在一定程度上减轻员工的法律责任和内部处分。
   • 退还非法所得：员工应退还因吃回扣而获得的非法所得，以表明其改正错误的决心和诚意。
   • 协商解决方案：员工可以与公司协商解决方案，如接受内部处分、承诺不再犯等。在协商过程中，员工可以寻求法律援助或咨询专业律师，以确保自己的权益得到合理保护。
   • 准备应对法律诉讼：如果公司选择通过法律途径解决，员工应做好应对法律诉讼的准备。这包括收集相关证据、了解法律程序、寻求法律援助等。

3. 预防措施与合规建议：

   • 加强合规培训：药店应定期对员工进行合规培训，提高员工的法律意识和合规意识，确保员工了解并遵守相关法律法规和公司内部规定。
   • 建立监督机制：药店应建立有效的监督机制，对员工的销售行为进行监督和检查，及时发现并纠正违规行为。
   • 完善内部制度：药店应完善内部制度，明确禁止员工在销售过程中吃回扣或接受不正当利益，并规定相应的处罚措施。

若你或药店面临此类问题，建议直接向我咨询，以便根据具体情况提供更详细的法律建议和解决方案。在处理此类问题时，务必保持谨慎和合规，以避免不必要的法律风险和损失。