结论：赃款退40万并取得谅解书后，检察院是否起诉并非绝对，而是取决于多种因素的综合考量。以下是对此问题的详细分析：
退赃与谅解书的作用：
- 退赃是犯罪嫌疑人或被告人表明悔罪态度、减轻社会危害性的一种重要方式。在刑事案件中，退赃往往被视为一个积极的量刑情节，有助于减轻或免除部分刑事责任。
- 谅解书则是被害人或其家属对犯罪嫌疑人或被告人的行为表示谅解的书面文件。它反映了被害人或其家属对犯罪嫌疑人或被告人的宽恕态度，也是法院量刑时考虑的一个重要因素。
检察院起诉的考量因素：
- 犯罪性质与情节：检察院在决定是否起诉时，会首先考虑犯罪的性质和情节。如果犯罪性质恶劣、情节严重，即使退赃并取得谅解书，检察院仍可能决定起诉。
- 社会危害性：检察院还会评估犯罪行为对社会造成的危害程度。如果犯罪行为对社会造成了严重危害，退赃和谅解书可能不足以阻止检察院的起诉决定。
- 犯罪嫌疑人的态度：犯罪嫌疑人的认罪态度、悔罪表现等也是检察院考虑的重要因素。如果犯罪嫌疑人能够积极退赃、真诚悔罪，并取得被害人的谅解，这有助于减轻检察院的起诉意愿。
- 法律与政策要求：检察院在决定是否起诉时，还需遵循相关法律和政策的要求。例如，对于某些特定类型的犯罪，法律可能规定了必须起诉的情形。
可能的情况分析：
- 如果犯罪性质较轻、情节轻微，且犯罪嫌疑人积极退赃、真诚悔罪，并取得被害人的谅解：在这种情况下，检察院可能会考虑不起诉或作出相对不起诉的决定。这体现了法律对犯罪嫌疑人悔罪态度的认可和对社会和谐的维护。
- 如果犯罪性质恶劣、情节严重，或犯罪行为对社会造成了严重危害：即使犯罪嫌疑人退赃并取得谅解书，检察院仍可能决定起诉。因为此时，退赃和谅解书不足以抵消犯罪行为的严重性和社会危害性。
建议与注意事项：
- 积极退赃与争取谅解：对于犯罪嫌疑人或被告人来说，积极退赃并争取被害人的谅解是明智之举。这有助于减轻刑事责任，甚至可能避免被起诉。
- 咨询专业律师：在处理此类案件时，建议犯罪嫌疑人或被告人及时咨询专业律师。律师可以根据案件的具体情况，提供有针对性的法律建议和辩护策略。
- 遵守法律程序：无论检察院是否起诉，犯罪嫌疑人或被告人都应遵守法律程序，配合司法机关的调查和审判工作。
总结来说，赃款退40万并取得谅解书后，检察院是否起诉取决于多种因素的综合考量。因此，无法给出绝对的答案。如果你或你身边的人面临此类情况，建议及时向我咨询，以便获得更具体、更专业的法律建议。