承包合同全部由发包方填写，并不直接决定其合法性，关键在于合同内容是否双方真实意思表示、是否违反法律法规强制性规定以及是否损害国家、集体或第三人利益。以下从几个方面进行详细分析：

1. 合同内容的真实性：

   • 合同是双方意思表示一致的产物。如果承包合同虽然全部由发包方填写，但承包方在签署前已经充分阅读并理解了合同内容，且合同内容反映了双方的真实意愿，没有欺诈、胁迫等情形，那么该合同在内容上是合法的。
   • 反之，如果发包方利用填写合同的机会，故意隐瞒重要信息、设置不公平条款或欺诈承包方，导致合同内容并非承包方真实意思表示，那么该合同可能因存在欺诈、胁迫等情形而被认定为无效或可撤销。

2. 合同条款的合法性：

   • 合同条款必须遵守国家法律法规的强制性规定。如果承包合同中的条款违反了法律、行政法规的强制性规定，如违反建筑法、招标投标法等相关规定，那么这些条款是无效的，但不影响合同其他部分的效力（除非其他部分也违反了法律法规的强制性规定）。
   • 例如，如果合同中约定了低于法定最低工资标准的劳动报酬，或者违反了关于工程质量和安全的标准，那么这些条款就是违法的，合同可能因此受到挑战。

3. 合同形式的合法性：

   • 虽然合同的形式（如书面、口头等）不是决定合同合法性的唯一因素，但在建设工程领域，由于合同涉及金额大、履行周期长、风险高，通常要求采用书面形式。如果承包合同全部由发包方填写，但双方已经以书面形式签署，且符合其他合法性要求，那么该合同在形式上是合法的。
   • 然而，如果合同虽然以书面形式存在，但签署过程存在瑕疵（如未加盖公章、法定代表人未签字等），或者合同内容被篡改且未经双方确认，那么该合同可能因形式不合法而受到质疑。

4. 实践建议：

   • 对于承包方而言，在签署承包合同前，应仔细阅读合同内容，确保理解并同意所有条款。如果对合同内容有疑问或异议，应及时与发包方沟通并协商修改。
   • 对于发包方而言，应确保合同内容的合法性和公平性，避免设置不公平条款或隐瞒重要信息。同时，在填写合同过程中，应尊重承包方的知情权和选择权，确保合同是双方真实意思表示的产物。

总结来说，承包合同全部由发包方填写并不直接决定其合法性。关键在于合同内容是否双方真实意思表示、是否违反法律法规强制性规定以及是否损害国家、集体或第三人利益。如果合同内容合法、双方意思表示真实且形式符合要求，那么该合同是合法的。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。