未持有有效包车合同从事道路客运经营，主要违反了《中华人民共和国道路运输条例》的相关规定。以下是对此问题的详细分析：

一、法律依据

根据《中华人民共和国道路运输条例》第十条的规定，申请从事客运经营的，应当依法向市场监督管理部门办理有关登记手续后，按照下列规定提出申请并提交符合本条例第八条规定条件的相关材料：……（二）从事省际、市际、县际（除毗邻县行政区域间外）客运经营的，向其所在地设区的市级道路运输管理机构提出申请；（三）从事县内客运经营的，向所在地县级道路运输管理机构提出申请。同时，该条例还明确要求，客运经营者需要取得相应的道路运输经营许可证，并持有有效的包车客运标志牌等文件，方可从事包车客运经营。虽然条例中并未直接提及“包车合同”，但包车合同作为客运经营中明确双方权利义务的重要文件，其有效性及持有情况是道路运输管理机构进行监管的重要内容之一。在实际操作中，未持有有效包车合同往往被视为未具备合法经营条件的一种表现。

二、法律后果

1. 行政处罚：对于未持有有效包车合同从事道路客运经营的行为，道路运输管理机构有权依据《中华人民共和国道路运输条例》的相关规定进行处罚。处罚措施可能包括警告、罚款、没收违法所得、责令停止经营等。具体处罚力度会根据违法情节的严重程度、是否造成危害后果等因素进行综合考量。

2. 法律责任：除了行政处罚外，未持有有效包车合同从事道路客运经营还可能涉及民事法律责任。例如，如果因未签订有效合同而导致乘客权益受损，客运经营者可能需要承担相应的赔偿责任。

三、建议与措施

1. 合规经营：客运经营者应严格遵守相关法律法规，确保在从事包车客运经营时持有有效的道路运输经营许可证、包车客运标志牌以及包车合同等文件。

2. 加强合同管理：客运经营者应重视包车合同的签订和管理，确保合同内容合法、有效，并明确双方的权利义务。同时，应妥善保管合同文件，以备道路运输管理机构检查。

3. 及时咨询与整改：如果客运经营者在经营过程中遇到相关法律问题或不确定自身是否合规，应及时咨询专业律师或道路运输管理机构，并根据咨询结果进行整改，以避免不必要的法律风险。

如果您在道路客运经营中遇到任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况提供专业的法律意见和解决方案。