关于员工工资的合理计算，特别是加班费和绩效的计算，这是一个涉及劳动合同、公司政策以及国家法律法规的复杂问题。以下是我为您提供的详细解答：

一、加班时间的确定与加班费的计算基数

1. 加班时间的确定：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》，每日工作不超过8小时，每周工作不超过44小时，超出此标准即为加班。
   • 加班类型分为平日延长工作时间（加点）、休息日加班、法定节假日加班，每种类型的加班费计算方式有所不同。

2. 加班费的计算基数：

   • 首先依据劳动合同中的约定，若劳动合同中明确约定了工资数额及绩效工资与加班工资计算基数的关系，则按约定执行。
   • 若劳动合同无约定，但集体合同中有明确规定，则按集体合同执行。
   • 若两者均未约定，一般按照劳动者正常出勤月工资的70%确定，但不得低于当地最低工资标准。绩效工资如与工作成果直接挂钩且不属于正常出勤月工资范畴，则不计入加班工资基数；若具有稳定性、规律性发放，则通常纳入。

二、加班费的计算标准与公式

1. 工作日延长工作时间：

   • 支付不低于工资的150%的工资报酬。
   • 计算公式：加班费 = 加班费计算基数 ÷ 21.75 ÷ 8 × 加班时数 × 1.5倍

2. 休息日加班：

   • 不能安排补休的，支付不低于工资的200%的工资报酬。
   • 计算公式：加班费 = 加班费计算基数 ÷ 21.75 × 休息日加班天数 × 2倍

3. 法定休假日加班：

   • 无论是否安排补休，都支付不低于工资的300%的工资报酬。
   • 计算公式：加班费 = 加班费计算基数 ÷ 21.75 × 法定休假日加班天数 × 3倍

三、绩效工资与加班的结合方式

1. 基础工资与绩效工资的区分：

   • 绩效工资通常基于员工在正常工作时间内的工作表现，而加班工资则针对额外工作时间。

2. 公司政策与劳动合同的查阅：

   • 必须查看公司是否有关于加班绩效工资的具体规定，或劳动合同中是否包含相关条款，以明确加班费与绩效工资的关联方式。

3. 结合方式：

   • 直接关联：加班时长和成果直接纳入绩效评估体系，加班越多、完成工作量越大，绩效得分越高。
   • 间接关联：加班所创造的业绩或成果影响绩效工资，如因加班完成项目带来显著效益，则在绩效评估时给予相应奖励。

4. 绩效考核周期的考虑：

   • 绩效工资与特定的绩效考核周期（如月度、季度、年度）相关联，在确定加班绩效工资时，需综合考量周期内员工的整体表现和加班情况。

四、注意事项与合法权益保护

1. 加班费发放：

   • 加班费应合并在正常工资中发放，不得单独处理。

2. 地方法规差异：

   • 各地对于加班工资的具体规定可能存在差异，实际计算时需参考当地法律法规。

3. 合法权益维护：

   • 用人单位未按规定支付加班费，劳动者有权向劳动保障监察机构举报投诉，或通过劳动仲裁、诉讼等方式维权。

综上所述，员工工资的合理计算，特别是加班费和绩效的计算，需要综合考虑劳动合同约定、公司政策、加班类型及时间、工资基数以及国家法律法规等多个因素。在实际操作中，应严格遵循相关法律法规和劳动合同约定，确保劳动者的合法权益得到充分保障。如有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时咨询。