被告在赔付完原告停运损失费后，若符合一定条件，仍然可以起诉保险公司要求赔偿。具体分析如下：

1. 保险合同关系独立于侵权关系
   被告与原告之间的赔付是基于侵权责任（如交通事故责任），而被告与保险公司之间是保险合同关系。根据《保险法》第六十五条，保险人对责任保险的被保险人给第三者造成的损害，可依照法律规定或合同约定直接向第三者赔偿。但若被告已先行赔付原告，其仍有权依据保险合同向保险公司主张权利，要求保险公司承担保险责任范围内的赔偿。

2. 需满足保险合同条款及法定条件

   • 保险范围覆盖：停运损失是否属于保险合同约定的赔偿范围（如交强险或商业三者险的条款）。若合同明确排除停运损失，则保险公司可能拒赔。
     
   • 无免责事由：保险公司需证明存在法定或约定的免责事由（如被告无证驾驶、酒驾等），否则应承担赔偿责任。
     
   • 及时报案与定损：被告需在事故发生后及时通知保险公司并配合定损，否则可能影响理赔。

3. 诉讼时效与程序要求

   • 被告需在保险合同约定的诉讼时效内（通常为2年）提起诉讼，否则可能丧失胜诉权。
     
   • 需提供证据证明赔付原告的停运损失金额合理（如维修记录、营运证明、评估报告等），以支持其对保险公司的索赔请求。

建议：
被告应首先审查保险合同条款，确认停运损失是否在保障范围内；同时收集赔付原告的相关证据（如赔偿协议、转账记录等），以及事故责任认定材料。若保险公司拒赔，可通过诉讼主张权利。如有具体合同或案件细节，可进一步向我咨询以制定针对性策略。