被公司查出吃佣金，可能面临公司内部处理及法律风险，具体处理方式需结合实际情况判断，以下分情况说明：

1. 若吃佣金行为仅违反公司内部规章制度
   公司可能依据《劳动合同法》及内部《员工手册》等规定，采取警告、记过、降薪、调岗、解除劳动合同等措施。此时需重点关注：

   • 公司规章制度是否合法：若规章制度未经民主程序制定（如未召开职工代表大会讨论）、未公示或未送达员工，则可能被认定为无效，公司以此解除劳动合同可能构成违法解除。
     
   • 证据充分性：公司需提供充分证据证明员工存在吃佣金行为（如合同、转账记录、证人证言等），否则员工可否认并要求公司承担举证不能的后果。
     
   • 处理程序合规性：公司应按规章制度规定的程序处理（如调查、听证、告知申诉渠道等），若程序违法，员工可主张赔偿。
     

2. 若吃佣金行为涉嫌职务侵占或非国家工作人员受贿罪
   根据《刑法》第271条（职务侵占罪）及第163条（非国家工作人员受贿罪），若员工利用职务便利，将公司财物非法占为己有（数额较大，通常6万元以上），或索取/收受他人财物为他人谋取利益（数额较大，通常6万元以上），可能面临刑事处罚。此时需注意：

   • 刑事风险与民事赔偿的区分：即使公司不追究刑事责任，仍可能要求员工返还侵占财产并赔偿损失；若公司报案，公安机关立案后，员工可能被采取强制措施（如拘留、逮捕）。
     
   • 自首与退赃的减轻情节：若员工主动向公司坦白、退还赃款，或向公安机关自首，可依法从轻、减轻或免除处罚。
     
   • 刑事辩护策略：若已进入刑事程序，需结合证据情况，论证是否构成犯罪（如是否利用职务便利、是否达到数额标准、是否存在合法授权等），争取不批捕、不起诉或缓刑。
     

3. 员工应对建议

   • 核实公司指控依据：要求公司出具书面证据，明确吃佣金的具体事实、金额及计算方式，避免模糊指控。
     
   • 评估行为性质：若仅是轻微违规（如未造成公司损失），可主动承认错误、承诺改正，争取从轻处理；若涉及刑事风险，立即咨询律师，避免自行与公司或第三方沟通导致证据固定。
     
   • 协商解决：尝试与公司协商和解（如退还佣金、接受轻微处分），避免矛盾激化；若公司处理过重，可申请劳动仲裁或提起诉讼。
     
   • 保留证据：保存与公司的沟通记录（如邮件、微信）、工资条、劳动合同等，以备后续维权使用。
     

总结：被公司查出吃佣金后，需第一时间分析行为性质（违规还是犯罪）、公司处理依据及证据充分性，再决定是主动认错、协商解决还是通过法律途径维权。若涉及刑事风险，务必谨慎处理，避免因应对不当导致更严重后果。如有具体问题，可直接向我咨询。