医务人员擅自离岗50分钟的处理需结合具体情节、医院规章制度及劳动法律法规综合判断，可能涉及行政处分、劳动合同解除或民事赔偿等法律后果。具体分析如下：

1. 医院内部规章制度的适用

• 离岗性质认定：需首先确认离岗是否属于“旷工”或“擅离职守”。若医院规章制度明确规定“未经批准离岗超过30分钟视为旷工”，则50分钟离岗可能构成严重违纪。
• 处分依据：根据《劳动合同法》第4条，医院可依法制定规章制度，但需满足“内容合法、程序民主、公示告知”三要件。若制度合法有效，医院可依据《事业单位工作人员处分暂行规定》或内部《员工手册》对医务人员给予警告、记过、降级、撤职甚至开除等处分。
• 程序要求：处分需经调查取证、听取陈述申辩、工会或职工代表大会审议等程序，确保程序合法。

2. 劳动合同解除的合法性

• 严重违纪解除：若离岗导致严重后果（如患者死亡、医疗事故等），医院可依据《劳动合同法》第39条以“严重失职，造成重大损害”为由解除合同，且无需支付经济补偿。
• 普通违纪解除：若未造成严重后果，但离岗行为符合规章制度中“严重违反劳动纪律”的情形（如累计旷工达一定天数），医院也可解除合同，但需支付经济补偿（若未提前30日通知则需支付代通知金）。
• 风险点：医院需证明离岗行为与损害后果之间的因果关系，否则可能构成违法解除，需支付赔偿金（2N）。

3. 民事赔偿责任的可能性

• 患者损害赔偿：若离岗导致患者未能及时救治，医院可能因医务人员过错承担医疗损害赔偿责任（《民法典》第1218条）。医务人员若存在重大过失，医院可依据《民法典》第1191条向其追偿。
• 举证责任：患者需证明离岗行为与损害结果之间的因果关系，医院需提供监控记录、排班表等证据反驳。

4. 特殊情形下的处理

• 紧急情况离岗：若医务人员因突发疾病、家庭紧急事务等合理事由离岗，且已履行报备或补假手续，可能不构成违纪。
• 工会介入：若医务人员对处分不服，可依据《劳动合同法》第43条要求工会介入，或通过劳动仲裁、诉讼主张权利。

建议行动步骤

1. 医院方：

   • 立即调查离岗原因，固定证据（如监控、证人证言）；
   • 核对规章制度是否合法有效；
   • 依据制度作出处分决定，并履行告知义务；
   • 若涉及患者损害，同步启动医疗事故鉴定程序。

2. 医务人员方：

   • 核实离岗是否因不可抗力或合理事由；
   • 检查医院规章制度是否经民主程序制定；
   • 若认为处分不当，可申请劳动仲裁或提起诉讼。

提示：具体处理需结合医院规章制度、离岗后果及证据情况综合判断。如有进一步疑问，可直接向我咨询医疗法律领域相关问题。