核心结论：如果竞业协议只有一份在公司，您仍可通过合法途径主张权利，但需注意证据固定和程序合规性。以下是具体分析及建议：
1. 竞业协议的效力不因单份留存而受影响
根据《劳动合同法》第二十三条，竞业限制协议自双方签字或盖章时成立并生效，协议的物理载体（如是否由员工持有副本）不影响其法律效力。即使公司未主动提供副本，只要您曾签署过该协议，即视为双方达成合意。
建议：
- 若公司以“未持有协议”为由否认竞业限制义务，您可要求公司出示协议原件或通过其他证据（如邮件、聊天记录、工资中已支付的竞业补偿记录等）证明协议存在。
- 若公司拒绝提供，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求公司履行协议披露义务。
2. 员工有权要求公司提供协议副本
根据《劳动合同法》第十六条，劳动合同文本由用人单位和劳动者各执一份。竞业限制协议作为劳动合同的补充附件，员工同样享有持有副本的权利。
操作步骤：
- 书面要求公司提供：通过邮件或书面函件向公司HR或法务部门提出请求，明确要求提供竞业协议副本，并保留送达证据（如快递回执、邮件截图）。
- 若公司拒绝：可向当地劳动监察大队举报，或以“未依法提供劳动合同文本”为由申请劳动仲裁，要求公司交付副本（依据《劳动合同法》第八十一条）。
3. 竞业限制义务的履行与证据固定
即使未持有协议副本，您仍需谨慎履行竞业限制义务（如不入职竞争企业、不泄露商业秘密），否则可能面临高额违约金。但同时需注意：
- 公司需按月支付补偿：根据《最高人民法院关于审理劳动争议案件适用法律问题的解释（一）》第三十六条，若公司连续3个月未支付补偿，您有权解除竞业限制义务且无需承担违约责任。
- 固定公司违约证据：若公司未支付补偿，需通过银行流水、沟通记录等证明其违约，作为后续主张权利的依据。
4. 特殊情形处理
- 协议未签署或公司伪造协议：若您从未签署竞业协议，可申请笔迹鉴定；若公司伪造协议，可能涉及欺诈，协议无效且公司需承担法律责任。
- 协议内容显失公平：若协议中竞业范围、期限、补偿标准等条款明显不合理（如限制期限超过2年、补偿低于当地最低工资），可申请仲裁或诉讼变更或撤销协议。
总结：竞业协议单份留存公司不影响其效力，但您需通过合法途径获取副本并固定证据。若公司未履行义务（如未支付补偿），您可主动维权。如有具体争议或需进一步分析协议条款，可直接向我咨询，我会结合协议内容为您提供详细方案。