竞业协议并非只有公司持有才有效，其有效性主要取决于协议内容是否合法、双方意思表示是否真实以及是否满足法律规定的生效条件，与协议由哪一方持有并无直接关系。以下是对此问题的详细分析：

一、竞业协议的法律基础与生效条件

竞业协议，通常指的是用人单位与劳动者之间约定的，在劳动关系存续期间或劳动关系结束后的一定期限内，劳动者不得在与用人单位有竞争关系的其他单位任职，或者自己开业生产或经营与用人单位有竞争关系的同类产品、从事同类业务的协议。其法律基础主要来源于《劳动合同法》等相关法律法规。

竞业协议的生效，一般需要满足以下条件：

1. 双方意思表示真实：竞业协议必须是用人单位与劳动者双方真实意思的表示，不存在欺诈、胁迫等情形。
2. 内容合法：竞业协议的内容不得违反法律、行政法规的强制性规定，不得违背公序良俗。例如，竞业限制的范围、地域、期限等应当合理，不得过分限制劳动者的就业权利。
3. 书面形式：虽然法律并未明确规定竞业协议必须采用书面形式，但为了证明双方之间的约定，以及便于在发生争议时举证，建议采用书面形式签订竞业协议。

二、竞业协议的持有与有效性

竞业协议的持有方，即协议文本由哪一方保管，并不影响协议的效力。无论是公司持有还是劳动者持有，只要协议本身满足上述生效条件，就是有效的。

1. 公司持有竞业协议：公司作为用人单位，持有竞业协议是常见的做法。这有助于公司管理劳动者的竞业行为，维护公司的商业秘密和竞争优势。
2. 劳动者持有竞业协议：在某些情况下，劳动者也可能持有竞业协议的副本或原件。这并不影响协议的效力，只要双方对协议内容无异议，且协议满足生效条件。

三、竞业协议的实际操作与注意事项

在实际操作中，为了确保竞业协议的有效性，双方应注意以下几点：

1. 明确竞业限制的范围、地域和期限：这些条款应当合理且具体，以便双方明确各自的权利和义务。
2. 约定经济补偿：根据《劳动合同法》的规定，用人单位与劳动者约定竞业限制条款的，应当在竞业限制期限内按月给予劳动者经济补偿。这是劳动者遵守竞业限制义务的对价。
3. 及时签订并妥善保管协议：双方应在劳动关系建立或变更时及时签订竞业协议，并妥善保管协议文本。在发生争议时，协议文本是证明双方约定的重要证据。

四、竞业协议无效或可撤销的情形

虽然竞业协议在满足一定条件下是有效的，但也存在无效或可撤销的情形。例如：

1. 协议内容违法：如果竞业协议的内容违反法律、行政法规的强制性规定，或者违背公序良俗，那么该协议是无效的。
2. 存在欺诈、胁迫等情形：如果一方在签订竞业协议时存在欺诈、胁迫等情形，导致另一方在违背真实意思的情况下签订协议，那么受欺诈或胁迫方有权请求人民法院或仲裁机构撤销该协议。

总结来说，竞业协议的有效性并不取决于协议由哪一方持有，而是取决于协议内容是否合法、双方意思表示是否真实以及是否满足法律规定的生效条件。因此，无论公司还是劳动者持有竞业协议，只要协议本身满足这些条件，就是有效的。如果您在竞业协议方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。