在商业交易中，关于“合同能否约定不开发票”的问题，这是一个涉及税收法律法规和商业交易规范的重要议题。
首先，明确结论：合同中不能约定不开发票。这是因为发票的开具是基于实际发生的应税销售行为，这是我国税收相关法律法规的明确要求。发票作为交易完成的财务凭证，不仅对于购买方而言是成本费用列支和财务核算的重要依据，对于销售方而言也是履行纳税义务、维护纳税合规性的必要证明。
接下来，详细解释法律依据与原理：
根据我国税收法律法规，发票是在购销商品、提供或者接受服务以及从事其他经营活动中开具、收取的收付款凭证。这意味着，只要存在真实的交易活动，无论双方是否签订了合同，销售方都有义务向购买方开具发票。合同虽然是明确交易细节、保障双方权益的重要法律文件，但它并不能替代发票作为财务凭证的法律地位。
再来看具体操作与注意事项：
优先签订合同：尽管合同不能约定不开发票，但签订合同仍然是商业交易中不可或缺的一环。合同可以详细列明交易的具体内容、金额、时间、交付方式、违约责任等条款，为双方提供全面的法律保护。
依法开具发票：无论是否签订合同，销售方都应依法开具发票。在开具发票时，应使用合法的开票系统，准确填写各项发票栏次，确保发票内容真实、准确地反映实际交易情况。
留存相关凭证：为了证明交易的真实性和合法性，销售方应留存能够证明交易真实性的相关凭证，如发货单、收货单、服务确认单、付款记录等。这些凭证在税务机关检查或发生税务争议时可作为重要证据。
最后，分析对双方的影响：
对于销售方而言，依法开具发票是其法定义务，有助于维护纳税合规性，避免税务处罚。同时，合同的存在可以为其提供更全面的法律保护，确保交易条款的明确性和可执行性。
对于购买方而言，取得合法有效的发票是其重要权益，有助于企业成本费用列支和财务核算。此外，合同的存在可以为其提供维权依据，确保在购买的商品或服务出现问题时能够依据合同条款进行索赔或寻求法律援助。
综上所述，合同中不能约定不开发票。为了确保双方权益和交易的顺利进行，建议优先签订合同并在合同中明确交易细节和各自的权利义务。同时，双方都应依法履行开具和取得发票的义务，并留存相关凭证以证明交易的真实性和合法性。