在掩饰、隐瞒犯罪所得及其收益罪中，若下游犯罪的违法所得并非直接源于上游犯罪被害人的合法财产，是否予以没收，需结合具体情况及相关法律规定进行综合判断。以下从不同角度进行分析：
一、法律规定基础
根据《中华人民共和国刑法》第六十四条的规定：“犯罪分子违法所得的一切财物，应当予以追缴或者责令退赔；对被害人的合法财产，应当及时返还；违禁品和供犯罪所用的本人财物，应当予以没收。没收的财物和罚金，一律上缴国库，不得挪用和自行处理。”这一条款为违法所得的没收提供了基本法律依据。
二、违法所得的认定与没收原则
违法所得的认定：违法所得是指犯罪分子通过犯罪行为所获得的财物或利益。在掩饰、隐瞒犯罪所得及其收益罪中，违法所得通常指的是下游犯罪行为人通过掩饰、隐瞒上游犯罪所得及其收益而获得的财物或利益。
没收原则：
- 直接关联原则：若下游犯罪的违法所得直接来源于上游犯罪的违法所得（如通过销售、转移等方式获得），则这些违法所得应当予以没收。
- 间接关联原则：若下游犯罪的违法所得并非直接来源于上游犯罪的违法所得，而是通过其他方式获得（如利用上游犯罪所得产生的收益进行投资、经营等），则是否没收需根据具体情况判断。此时，需考虑下游犯罪行为人的主观故意、违法所得的性质、来源及与上游犯罪的关联程度等因素。
三、具体情形分析
下游犯罪违法所得直接来源于上游犯罪违法所得：
- 在此情形下，下游犯罪行为人通过掩饰、隐瞒上游犯罪所得及其收益而获得的财物或利益，显然属于违法所得，应当予以没收。
下游犯罪违法所得间接来源于上游犯罪违法所得：
- 若下游犯罪行为人明知其违法所得来源于上游犯罪所得及其收益：即使这些违法所得并非直接来源于上游犯罪的违法所得，而是通过其他方式获得，如利用上游犯罪所得产生的收益进行投资、经营等，且下游犯罪行为人对此明知，则这些违法所得仍可能被视为与上游犯罪有关联，从而予以没收。
- 若下游犯罪行为人不知其违法所得来源于上游犯罪所得及其收益：在此情形下，下游犯罪行为人的违法所得可能被视为独立于上游犯罪的财产，是否没收需根据其他相关法律规定和案件具体情况进行判断。例如，若下游犯罪行为人通过合法手段获得这些财物或利益，且没有证据表明其与上游犯罪有关联，则可能不予没收。
四、实践中的考量因素
在司法实践中，判断下游犯罪违法所得是否应予没收时，还需考虑以下因素：
- 下游犯罪行为人的主观故意：是否明知其违法所得来源于上游犯罪所得及其收益。
- 违法所得的性质、来源及与上游犯罪的关联程度：是否直接或间接来源于上游犯罪的违法所得。
- 案件的具体情况：如下游犯罪行为人的犯罪手段、情节、社会危害程度等。
总结与建议：在掩饰、隐瞒犯罪所得及其收益罪中，若下游犯罪的违法所得并非直接源于上游犯罪被害人的合法财产，是否予以没收需结合具体情况及相关法律规定进行综合判断。若您或他人涉及此类案件，建议直接向我咨询，以便根据案件具体情况提供更准确的法律意见。