公司司机员工出差加班时间的核定，需结合工作性质、实际出勤及法律规定综合判断，具体可从以下角度分析：

1. 加班时间的认定标准
   根据《劳动法》第四十四条，加班时间通常指超出标准工作时间的部分（如每日8小时、每周40小时）。对于司机岗位，需区分正常出勤与加班：

   • 驾驶时间：若司机在出差期间连续驾驶超过4小时（或累计超过8小时），超出部分可能被认定为加班（需结合地方规定，如《道路交通安全法实施条例》对连续驾驶时间的限制）。
     
   • 等待或待命时间：若司机在出差地需随时待命（如等待领导安排任务），且无法自由支配时间，可能被认定为工作时间，进而计入加班。
     
   • 休息日或法定节假日工作：若出差涉及周末或法定节假日，司机仍需工作的，应直接认定为加班。

2. 核定加班时间的具体方法

   • 记录出勤情况：要求司机填写详细的出差日志，记录驾驶时间、等待时间、休息时间等，并附相关证据（如高速通行记录、住宿发票等）。
     
   • 区分工作与休息：明确司机在出差期间的休息时间（如住宿、用餐）是否属于工作时间。若休息时间可自由支配（如自行安排活动），则不计入加班；若需随时待命，则可能计入。
     
   • 参考行业标准：若公司无明确规定，可参考同行业或地区对司机加班时间的认定惯例（如物流行业对长途驾驶的加班计算方式）。

3. 加班工资的计算依据

   • 工作日加班：支付不低于工资150%的加班费；
     
   • 休息日加班：若无法安排补休，支付不低于工资200%的加班费；
     
   • 法定节假日加班：支付不低于工资300%的加班费。
     注：司机岗位可能涉及不定时工作制，若公司已申请并获批，则加班工资计算可能适用特殊规定（如仅支付法定节假日加班费）。

4. 实务建议

   • 完善公司制度：制定明确的《司机出差加班管理办法》，规定加班认定标准、记录方式及工资计算规则。
     
   • 留存证据：要求司机保留出差期间的各类凭证（如加油票、过路费发票、住宿记录等），以佐证加班时间。
     
   • 定期审核：人力资源部门应定期审核司机提交的加班记录，确保合规性，避免纠纷。

若公司对司机加班时间核定存在争议，建议结合具体证据（如出差日志、行车记录仪数据等）与员工协商解决；协商不成，可依法申请劳动仲裁。 如有进一步疑问，可直接向我咨询。