在仲裁过程中，当涉及一个法人多个个体店铺的情况时，确认主体主要需考虑店铺的法律地位、与法人的关系以及合同签订情况等因素。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

1. 店铺的法律地位：

   • 独立法人资格：如果个体店铺具有独立的法人资格（尽管在实际情况中，个体店铺通常不具备独立法人资格，但此处为全面分析而提及），则其应作为独立的仲裁主体。然而，在大多数情况下，个体店铺并不具备独立法人资格，而是作为法人的分支机构或组成部分存在。
   • 非法人分支机构：若个体店铺是法人的非法人分支机构，如分公司或办事处等，且没有独立的财产和责任能力，那么在仲裁中，通常应将法人作为仲裁主体。分支机构的行为后果应由法人承担。

2. 与法人的关系：

   • 内部关系：需要明确个体店铺与法人之间的内部关系，包括是否受法人统一管理、财务是否独立等。这些因素将影响仲裁主体的确认。例如，如果个体店铺在财务、业务等方面均独立于法人，且有自己的经营自主权，那么在某些情况下，可能将其视为独立的仲裁主体（尽管这在实际操作中较为罕见）。
   • 外部表现：还需考虑个体店铺在外部交易中的表现。如果个体店铺以自己的名义与第三方签订合同，并明确承担合同责任，那么在仲裁中，可能将其视为合同的一方主体。然而，如果合同中明确约定了法人作为合同主体，或个体店铺的行为被视为法人的代理行为，则法人应为仲裁主体。

3. 合同签订情况：

   • 合同主体：审查合同中的主体条款，明确是法人还是个个体店铺作为合同的一方。如果合同中明确约定了法人作为主体，那么仲裁时应以法人为对象。
   • 代理关系：如果个体店铺在签订合同时是作为法人的代理人，且合同中明确或隐含地表明了这一点，那么仲裁主体应为法人。在此情况下，个体店铺的行为后果应由法人承担。

4. 实际操作建议：

   • 审查证据：在仲裁过程中，应仔细审查与案件相关的所有证据，包括合同、发票、付款记录等，以明确个体店铺与法人之间的关系以及合同的实际签订情况。
   • 咨询专业意见：由于涉及复杂的法律关系和合同条款，建议在仲裁前咨询专业律师的意见，以确保正确确认仲裁主体并维护自身权益。

在确认仲裁主体时，应综合考虑店铺的法律地位、与法人的关系以及合同签订情况等因素。如果个体店铺不具备独立法人资格且作为法人的分支机构或组成部分存在，那么在仲裁中通常应将法人作为仲裁主体。然而，具体情况还需根据合同条款和实际交易情况来判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。