法院在判断此类案件时，会综合考量多方面因素，核心在于判断公司是否合法取得相关权益以及农户行为是否构成侵权，具体如下：

1. 审查公司用地行为的合法性

   • 土地来源与审批手续：法院首先会审查公司取得农户承包经营权地块的方式是否合法。如果公司是通过合法流转程序，如与农户签订了规范的土地承包经营权流转合同，并且该合同经过了发包方（通常是村集体经济组织）的备案，同时公司按照规定办理了相关的土地用途变更审批手续（如果涉及土地用途改变），那么公司对该地块的使用在程序上可能是合法的。例如，公司为了建设农业产业园区，与农户协商一致并签订了土地流转合同，将土地用于农业种植相关设施建设，且经过了当地农业部门和国土部门的审批，这种情况下公司的用地行为具有合法性基础。
   • 土地用途是否符合规定：即使公司取得了土地的使用权，还需要审查其使用土地的用途是否符合法律法规和合同约定。如果公司擅自改变土地的农业用途，用于非农建设，如建设工厂、商业楼盘等，那么其用地行为可能违法。在这种情况下，公司不仅不能主张农户侵权，还可能面临相关部门的行政处罚。例如，农户将土地承包给公司时约定用于种植农作物，但公司却在该土地上建设了度假村，这就违反了土地用途管制规定。

2. 分析农户行为的性质

   • 是否基于合法权利行使：如果农户的承包经营权仍然合法有效，且公司存在违法用地行为，那么农户阻止公司使用土地的行为可能是基于其合法的承包经营权进行的自我保护，不构成侵权。例如，公司未与农户签订流转合同，强行占用农户承包地，农户为了维护自己的土地权益而采取措施阻止公司施工，这是农户合法行使权利的表现。
   • 行为方式是否合理合法：即使农户认为公司的用地行为侵犯了其权益，其维权行为也应当在法律允许的范围内进行。如果农户采取过激、违法的手段，如破坏公司的设施、殴打公司工作人员等，那么农户的这些行为可能构成侵权，需要承担相应的法律责任。例如，农户为了阻止公司施工，将公司的施工设备砸坏，这就超出了合法维权的范畴，应当对公司的损失进行赔偿。

3. 考虑合同约定和双方过错

   • 合同约定情况：如果公司和农户之间存在土地流转合同，合同中明确约定了双方的权利义务，那么法院会根据合同约定来判断双方的行为是否违约或侵权。例如，合同中约定公司在一定期限内可以使用土地，并支付相应的流转费用，但公司未按照约定支付费用，农户因此阻止公司使用土地，这种情况下公司存在违约行为，农户的行为可能具有一定的合理性。
   • 双方过错程度：在判断侵权责任时，法院还会考虑双方的过错程度。如果公司的用地行为存在一定瑕疵，但农户的行为也存在不当之处，法院会根据双方的过错大小来分担责任。例如，公司虽然办理了部分审批手续，但尚未完全完成，就开始使用土地，而农户在发现后没有通过合法途径解决，而是直接采取暴力手段阻止，那么双方都可能存在一定的过错，法院会根据具体情况确定双方的责任比例。

综上所述，法院会根据公司的用地合法性、农户行为的性质以及合同约定和双方过错等多方面因素进行综合判断，以确定农户是否构成侵权以及责任如何承担。如果你有具体的案件情况，可以直接向我咨询，我会为你提供更详细的分析和建议。