在行政案件中，若行政行为被确认无效后，给予的全面赔偿通常包括直接损失赔偿和合理范围内的间接损失赔偿，具体涵盖以下几个方面：
直接财产损失赔偿：
- 因行政行为导致的财产直接减少：例如，因行政机关的错误征收、罚款等行为导致的财产损失，行政机关应当予以全额赔偿。这包括被征收的财物价值、被罚款的金额等直接经济损失。
- 恢复原状的费用：如果行政行为导致财产损坏或灭失，且有可能恢复原状的，赔偿应包括恢复原状所需的合理费用。例如，因行政机关的违法拆除行为导致的建筑物损坏，赔偿应涵盖重建或修复的费用。
合理范围内的间接损失赔偿：
- 可得利益损失：在行政行为无效导致当事人丧失了原本可以获得的利益时，如因行政许可被违法撤销而导致的经营损失，行政机关应在合理范围内予以赔偿。这种赔偿通常需要考虑当事人的实际损失情况、预期利益的合理性以及行政行为与损失之间的因果关系。
- 其他间接经济损失：如因行政行为导致的交通费、住宿费、误工费等因处理行政争议而产生的合理费用，也可以纳入赔偿范围。但需要注意的是，这些费用必须是合理且必要的，且需要与行政行为有直接的因果关系。
精神损害赔偿（在特定情况下）：
- 虽然精神损害赔偿在行政赔偿中相对较少见，但在某些特定情况下，如行政行为严重侵犯了当事人的人身权或名誉权，导致当事人遭受严重的精神痛苦时，也可以考虑给予一定的精神损害赔偿。不过，这种赔偿通常需要严格的法律条件和证据支持。
在申请全面赔偿时，需要注意以下几点：
- 及时提出赔偿请求：根据《中华人民共和国国家赔偿法》的相关规定，当事人应当在知道或应当知道行政行为侵犯其合法权益之日起一定期限内（通常为两年）提出赔偿请求。逾期提出的，可能不予受理。
- 提供充分证据：在申请赔偿时，当事人需要提供充分的证据证明其损失情况以及损失与行政行为之间的因果关系。这包括但不限于财物损失清单、修复费用估算、经营损失证明等。
- 遵循法定程序：赔偿请求应当按照法定的程序进行，包括向赔偿义务机关提出赔偿申请、等待赔偿义务机关的处理决定、对处理决定不服时的复议或诉讼等。
举例说明：
假设某企业因行政机关的违法征收行为导致其厂房被拆除，且该征收行为后来被确认无效。在此情况下，企业可以申请的全面赔偿可能包括：厂房的重建费用（直接财产损失）、因拆除行为导致的生产中断损失（合理范围内的间接损失）以及因处理征收争议而产生的交通费、住宿费等合理费用。如果征收行为还严重侵犯了企业的名誉权，导致企业遭受严重的精神痛苦，且符合精神损害赔偿的条件，企业也可以考虑申请精神损害赔偿。
最后需要强调的是，每个行政案件的具体情况都有所不同，因此赔偿的范围和金额也会因案而异。如果您在行政案件中遇到了赔偿问题，建议直接向我咨询，以便根据您的具体情况提供更详细的法律建议。