结论前置：乙方盖好合同章后，合同通常是有效的，但具体效力还需结合合同内容、双方实际行为及法律规定综合判断。以下从不同角度为您详细分析：
一、合同成立与生效的基本条件
根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。这表明，双方当事人的签字或盖章是合同生效的重要条件之一。因此，在乙方已经盖好合同章的情况下，合同在形式上已经满足了成立的基本条件。
二、乙方盖章后合同效力的具体分析
双方均已盖章：
- 如果合同上不仅有乙方的盖章，还有甲方的盖章或签字，那么这份合同在法律上通常是成立的，并且自双方盖章或签字之日起生效。这是最常见且最直接的情况，合同效力明确无误。
仅乙方盖章，甲方未盖章但已实际履行：
- 即使甲方没有在合同上盖章，但如果甲方已经按照合同中的核心条款履行了主要义务，并且乙方对此表示认可并接受，那么这份合同仍然可以视为已经成立并有效。例如，在买卖合同中，如果乙方已交付货物，甲方接收并使用，即使甲方未盖章，合同关系也实际已经成立并生效。
乙方盖章存在瑕疵或无效情形：
- 如果乙方的盖章存在瑕疵，如使用假章、无效章等，或者乙方盖章的行为本身存在无效情形，如乙方为无民事行为能力人、盖章行为非乙方真实意思表示等，那么这份合同的效力可能会受到影响。在这种情况下，需要进一步分析盖章行为的具体情况和法律规定，以确定合同的效力。
三、综合判断与建议
审查合同内容：
- 在判断合同效力时，首先要审查合同的内容是否合法、合规，是否违反了法律、行政法规的强制性规定或公序良俗。如果合同内容存在违法或违规情形，那么即使乙方已经盖好合同章，合同也可能无效。
关注双方实际行为：
- 除了审查合同内容外，还要关注双方当事人的实际行为。如果甲方已经按照合同履行了主要义务，并且乙方对此表示认可并接受，那么即使甲方未盖章，合同也可能有效。反之，如果双方均未履行合同义务，或者一方履行了义务但另一方未接受，那么合同的效力可能会受到影响。
寻求法律帮助：
- 如果您对合同的效力存在疑问或争议，建议及时咨询专业律师。律师可以根据您的具体情况和法律规定，为您提供专业的法律意见和解决方案。
举例说明：假设您与一家公司签订了一份买卖合同，您作为乙方已经盖好了合同章，但甲方尚未盖章。然而，在合同签订后，甲方已经按照合同约定向您支付了货款，并且您也按照合同约定交付了货物。在这种情况下，即使甲方未盖章，合同也已经实际成立并生效，因为双方的实际行为已经表明了他们对合同内容的共识和接受。
最后提醒：在签订合同时，请务必确保合同内容合法、合规，并且双方当事人的签字或盖章真实有效。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。