结论：在合同被老板扣留的情况下，您仍然可以通过多种方式来证明劳动关系。以下是一些具体的方法和建议：

一、收集其他书面证据

1. 工作证、服务证：这些证件上通常会印有公司名称、您的姓名和职位等信息，是证明劳动关系的有力证据。
2. 考勤记录：如打卡记录、考勤表等，这些记录能够显示您的工作时间和出勤情况，从而证明您与公司之间的劳动关系。
3. 工资支付记录：包括银行转账记录、工资条等，这些记录能够证明公司向您支付了工资，是劳动关系存在的重要证据。
4. 招聘记录：如入职通知书、面试记录等，这些记录能够证明您是通过公司的招聘流程进入公司的，从而间接证明劳动关系。

二、收集电子证据

1. 电子邮件和聊天记录：如果您与公司之间通过电子邮件或即时通讯工具进行过工作沟通，这些记录也可以作为证明劳动关系的证据。请确保保存好这些电子证据，并尽可能打印出来或进行公证，以便在需要时提供。
2. 工作照片和视频：如果您在工作过程中拍摄了照片或视频，这些资料也可以作为证明您在公司工作的证据。

三、寻求证人证言

1. 同事证言：如果您有同事愿意为您作证，证明您在公司工作，那么他们的证言也可以作为证明劳动关系的证据。请确保同事的证言是真实、客观的，并尽可能提供他们的联系方式，以便在需要时进行核实。
2. 客户或合作伙伴证言：如果您在工作中与客户或合作伙伴有过接触，他们也可以为您提供证言，证明您在公司的工作情况。

四、申请劳动仲裁或诉讼时的特别建议

1. 在申请劳动仲裁或提起诉讼时，您可以向仲裁机构或法院说明合同被老板扣留的情况，并提供上述收集到的其他证据来证明劳动关系。仲裁机构或法院会根据您提供的证据进行综合判断，并作出相应的裁决或判决。
2. 如果可能的话，您可以尝试与公司进行协商，要求公司出具一份书面证明来确认劳动关系。虽然这可能需要一些时间和努力，但如果能够成功，将大大简化后续的法律程序。

五、法律背景与依据

根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的相关规定，发生劳动争议时，当事人对自己提出的主张有责任提供证据。因此，在证明劳动关系时，您需要积极收集并保存相关证据。同时，该法也规定了劳动争议仲裁委员会在受理仲裁申请后，有权向有关单位和个人调查取证，这为您在仲裁过程中获取更多证据提供了法律保障。

建议：在收集证据的过程中，请务必保持冷静和理性，不要采取过激或违法的行为。如果您在收集证据或证明劳动关系过程中遇到任何困难或问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供进一步的法律建议和帮助。