村合作社一般无权直接申请仲裁解除土地承包确权证，但特定情形下可通过法律途径主张权利。以下从不同角度展开分析：

1. 村合作社的法律地位与权利边界

• 村合作社作为集体经济组织，对集体土地享有管理权，但土地承包经营权确权证是政府对农户承包经营权的法定确认，具有物权效力。
• 根据《农村土地承包法》第二十三条，承包合同自成立之日起生效，承包方自合同生效时取得土地承包经营权，县级以上地方人民政府应当向承包方颁发土地承包经营权证。确权证的颁发与撤销属于行政行为，村合作社无权直接撤销或解除。

2. 村合作社可主张解除确权证的情形

若存在以下法定情形，村合作社可通过法律程序主张权利，但需通过行政复议或行政诉讼途径，而非直接申请仲裁：

• 确权程序违法：如确权过程中存在程序瑕疵（如未依法公示、未召开村民会议等），村合作社可向县级人民政府申请复查，或提起行政诉讼要求撤销确权证。
• 承包合同无效或被撤销：若承包合同因欺诈、胁迫、恶意串通等情形被法院或仲裁机构宣告无效或撤销，村合作社可依据生效法律文书，申请行政机关变更或注销确权证。
• 承包方违反法定义务：如承包方擅自改变土地用途、撂荒两年以上等，村合作社可依据《农村土地承包法》第四十二条、第六十四条等规定，要求承包方承担违约责任，或通过村民会议决议收回土地，但需依法报经原批准用地的人民政府批准，并办理确权证变更手续。

3. 仲裁的适用范围与限制

• 农村土地承包仲裁主要解决承包合同纠纷（如合同履行、违约责任等），而非直接撤销或解除确权证。
• 若村合作社与承包方就合同履行产生争议（如租金支付、土地用途等），可依据《农村土地承包经营纠纷调解仲裁法》申请仲裁，但仲裁裁决仅能解决合同纠纷，无法直接撤销确权证。确权证的变更仍需通过行政程序。

4. 实务建议

• 步骤一：核查确权程序是否合法，收集相关证据（如会议记录、公示材料等）。
• 步骤二：若存在程序违法或合同无效情形，向县级农业农村部门申请复查，或直接提起行政诉讼。
• 步骤三：若仅涉及合同纠纷，可依据仲裁协议申请仲裁，但需明确仲裁请求限于合同履行问题，而非确权证本身。

总结：村合作社无权直接申请仲裁解除确权证，但可通过行政复议、行政诉讼或仲裁（针对合同纠纷）等途径间接主张权利。具体操作需结合案件事实和法律依据，建议进一步提供细节以便针对性分析。