结论：在工厂上班后因身体原因选择自离，您仍然有权获得实际劳动期间应得的工资，但具体支付情况可能受到劳动合同约定、经济损失及法律规定的影响。以下是对这一问题的详细分析：
一、法律依据与基本原则
根据《中华人民共和国劳动法》及相关法律法规，劳动者享有取得劳动报酬的权利。无论您因何种原因离职，只要您为用人单位提供了实际劳动，用人单位就应当按照约定或国家有关规定支付相应的劳动报酬。这一原则确保了您的劳动价值不被忽视和剥夺。
二、工资计算与支付规定
工资计算：
- 用人单位应按照您实际出勤的天数和双方约定的工资标准来计算工资，这包括基本工资、绩效工资（若有）、加班工资等。
- 工资的计算应公平、合理，用人单位不得随意克扣或拖欠。
工资支付：
- 工资必须在用人单位与您约定的日期支付，如遇节假日或休息日，则应提前在最近的工作日支付。
- 劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清您的工资。
三、自离对工资支付的具体影响
违反劳动合同约定：
- 如果劳动合同中有关于擅自离职需承担违约责任的明确约定，且该约定不违反法律强制性规定，用人单位可以依据约定扣除部分工资用于支付违约金。但扣除后的工资不得低于当地最低工资标准。
给单位造成损失：
- 如果您的自离行为给用人单位造成了直接经济损失，如生产中断、订单延误等，用人单位可以要求您赔偿。赔偿通常从工资中扣除，但需满足以下条件：
- 用人单位需提供充分的证据证明损失的存在以及损失与您自离行为之间的因果关系。
- 每月扣除的部分不得超过您当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
四、特殊情况下的工资权益
- 如果您是由于用人单位不按照约定发放工资、提供劳动条件等原因，导致被迫自离，您不仅能正常获得工资，还可以要求单位支付经济补偿金或赔偿金。
五、建议与维权途径
建议：
- 在选择自离时，建议您尽量按照规定的程序办理离职手续，如提前告知用人单位、办理工作交接等，以减少可能的纠纷。
- 用人单位也应完善内部管理制度，确保劳动合同的签订和执行符合法律法规，避免不必要的法律风险。
维权途径：
- 如果用人单位拒绝支付您的合法工资，您可以通过以下途径来维护自身权益：
- 与用人单位协商解决；
- 向当地劳动监察部门投诉；
- 申请劳动仲裁；
- 提起诉讼（如必要）。
总结：因身体原因自离后，您仍然有权获得实际劳动期间的工资。但具体数额和支付方式需根据双方约定、实际情况及法律规定来确定。如果您在维权过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。